当前解析结果
SmilChr03G002869| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002869 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002869 |
| 描述 | probable WRKY transcription factor 75 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 45330831 - 45337388 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016017 |
|---|---|
| GeneID | 131016017 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016017 |
| 原始查询 | SmilChr03G002869 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable WRKY transcription factor 75 |
| 产物 | probable WRKY transcription factor 75 |
| Arabidopsis | AT5G13080 (WRKY75)WRKY DNA-binding protein 75 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831147] identity=81.5; qcov=0.554; evalue=3.92e-54; confidence=medium |
| Rice | Os11g0490900 (OsWRKY72)- identity=84; qcov=0.602; evalue=1.93e-61; confidence=high |
| GO | GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03106 (WRKY) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016017 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800553.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800553.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800553.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800553.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057800553.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:45330928 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057800553.1PF03106
WRKY 88-145 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057800553.1 |
Pfam | PF03106 |
WRKY | Domain | 88 | 145 | 4.2e-28 | 98.1 | WRKY DNA -binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。