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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002880`

染色体: Chr03 坐标: 45472510-45477828 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002880`
名称	SmilChr03G002880
描述	uncharacterized SmilChr03G002880
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45472510 - 45477828 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016039`
GeneID	`131016039`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016039`
原始查询	`SmilChr03G002880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835991]; symbol=cPT4; hit=AT5G58770; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835991]; symbol=cPT4; hit=AT5G58770; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G58770` (cPT4) Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835991] identity=47.1; qcov=0.765; evalue=2.07e-76; confidence=high
Rice	`Os01g0857200` - identity=44.2; qcov=0.772; evalue=2.25e-69; confidence=medium
GO	GO:0002094 (GO:0002094); GO:0009409 (response to cold); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0009668 (plastid membrane organization); GO:0016094 (polyprenol biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01255 (Prenyltransf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016039

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800565.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057800565.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800565.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800565.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800565.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45472543`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	120	A10,A13,A19,A20,A21,A24,A25,A4,B10,B104,B105,B106,B110,B111,B113,B118,B120,B122,B126,B127,B129,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B2,B24,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B41,B45,B46,B48,B52,B57,B59,B6,B61,B64,B65,B67,B7,B70,B72,B74,B79,B86,B87,B90,B91,B95,B97,B98,C13,C14,C15,C17,C20,C22,C25,C27,C29,C30,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C7,C70,C71,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr3:45472545`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	120	A10,A13,A19,A20,A21,A24,A25,A4,B10,B104,B105,B106,B110,B111,B113,B118,B120,B122,B126,B127,B129,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B2,B24,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B41,B45,B46,B48,B52,B57,B59,B6,B61,B64,B65,B67,B7,B70,B72,B74,B79,B86,B87,B90,B91,B95,B97,B98,C13,C14,C15,C17,C20,C22,C25,C27,C29,C30,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C62,C7,C70,C71,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr3:45472624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr3:45472907`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B110,B122,B32,C25,C5
`Chr3:45472907`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B110,B122,B32,C25,C5
`Chr3:45477544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B50,C33,C42
`Chr3:45477686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800565.1

311 aa

156

311

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 84-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800565.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	84	306	6.6e-70	235.8	Putative undecaprenyl diphosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944582.1
CACAGATTGAAAAGAAAATAGAAGAAAAATGCTATCAGTACAGTTAACTACAATTGTTTCAGCATCAAGATTGCTATCTCCTCCCAATTATGCCTTGTATTCAATCAAGGGTTCCAGCACTGCACGGAAACGAACTGTGAAGCGGCCGAATGCAATTGGTGGGTGTTTTTGTAATCCACCTCGTCCAACTAAGACACATTTGGCGTCTGCCTCAGCTTTAGGTGAAAATGAAAGTGATGGGGAGAAAAGTGAAGTGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016039
ATGCTATCAGTACAGTTAACTACAATTGTTTCAGCATCAAGATTGCTATCTCCTCCCAATTATGCCTTGTATTCAATCAAGGGTTCCAGCACTGCACGGAAACGAACTGTGAAGCGGCCGAATGCAATTGGTGGGTGTTTTTGTAATCCACCTCGTCCAACTAAGACACATTTGGCGTCTGCCTCAGCTTTAGGTGAAAATGAAAGTGATGGGGAGAAAAGTGAAGTGATGCCTAAACACGTCGCTATTATTTTGGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800565.1
MLSVQLTTIVSASRLLSPPNYALYSIKGSSTARKRTVKRPNAIGGCFCNPPRPTKTHLASASALGENESDGEKSEVMPKHVAIILDGNGRWAKNRKLPVQDGHRAGSQNLTCFISSCCELGIKTLSFFIFSKENWKRSQIEVNFLMTAIENHIRSDIMKLITRHNIQFSAIGNISRLPKSLQDAIFCAEEISRGNKGMNVVAAVSYSGRDDVIEATKKIATRVELGILRATDVDKTIFEQELMTNNLEFPNPDLLIRTSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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