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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002882`

染色体: Chr03 坐标: 45501049-45503141 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002882`
名称	SmilChr03G002882
描述	(2Z,6Z)-farnesyl diphosphate synthase CPT6, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45501049 - 45503141 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016040`
GeneID	`131016040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016040`
原始查询	`SmilChr03G002882`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(2Z,6Z)-farnesyl diphosphate synthase CPT6, chloroplastic-like
产物	(2Z%2C6Z)-farnesyl diphosphate synthase CPT6%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G58770` (cPT4) Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835991] identity=47.9; qcov=0.858; evalue=3.87e-78; confidence=high
Rice	`Os01g0857200` - identity=47.5; qcov=0.858; evalue=5.65e-73; confidence=high
GO	GO:0002094 (GO:0002094); GO:0009409 (response to cold); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0009668 (plastid membrane organization); GO:0016094 (polyprenol biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01255 (Prenyltransf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800566.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057800566.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800566.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800566.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45501130`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	B105,B106,B113,B30,B69,B90,B92,C20,C44,C58,C7,C78,C85,C9,D10
`Chr3:45501361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B129,B23,B29,B81
`Chr3:45502610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:45502611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B129,B23,B29,B81
`Chr3:45502613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B105,B9,C8,D9
`Chr3:45502614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B105,B9,C8
`Chr3:45502667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B27,B95,C59,C81
`Chr3:45502701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:45502719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:45502725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr3:45502740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:45502762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800566.1

275 aa

138

275

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 48-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800566.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	48	271	1e-73	248.2	Putative undecaprenyl diphosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944583.1
AAAACTAAGACACAGATTCCGAAAACAAAAGAAAAAAATGTTGGCGCTTCCGTTGAGTGCAGTTTTTCCAGCAGGGAAGCGAAGTTCTCCAGCCCTTCCAATTTGTAAGGCAGTTTTAAGTGAAAATAAAAGTGCAGTTGGAGTTGGAGAAGGGATGATGCCGAAACACGTGGGTATTATAATGGACGGAAGCGGAAGGTGGGCCCAACATAGGAACTTGCCGGTCCGAGATGGCCACAAAGCCAGTTCACAGAATCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016040
ATGTTGGCGCTTCCGTTGAGTGCAGTTTTTCCAGCAGGGAAGCGAAGTTCTCCAGCCCTTCCAATTTGTAAGGCAGTTTTAAGTGAAAATAAAAGTGCAGTTGGAGTTGGAGAAGGGATGATGCCGAAACACGTGGGTATTATAATGGACGGAAGCGGAAGGTGGGCCCAACATAGGAACTTGCCGGTCCGAGATGGCCACAAAGCCAGTTCACAGAATCTCACAGGCTTCATTTCCACCTGCTGTGAGCTCCAAATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800566.1
MLALPLSAVFPAGKRSSPALPICKAVLSENKSAVGVGEGMMPKHVGIIMDGSGRWAQHRNLPVRDGHKASSQNLTGFISTCCELQIKTLTIFSFSNENWKRSQMEVDILMRAIEDYIQTHLMNLIERYDIQFSAIGNKLRLPKSLQNTIYWAEEISKGNKGMNVVMAASYSGRDDIVEATKKIASKVKLGIVQTIDIDETMFEQELMTNFLEFPNPDLLIRTSGELRISNFLLWQLAYTEFYFADKCFPDFSEDDLCEAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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