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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002883`

染色体: Chr03 坐标: 45511281-45511824 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002883`
名称	SmilChr03G002883
描述	uncharacterized SmilChr03G002883
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45511281 - 45511824 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016041`
GeneID	`131016041`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016041`
原始查询	`SmilChr03G002883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF 3339) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241429]; symbol=AT5G08391; hit=AT5G08391; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transmembrane protein, putative (DUF 3339) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241429]; symbol=AT5G08391; hit=AT5G08391; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G08391` (AT5G08391) transmembrane protein, putative (DUF 3339) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241429] identity=49.2; qcov=0.957; evalue=1.45e-22; confidence=medium
Rice	`Os01g0923200` - identity=53.6; qcov=0.986; evalue=3.45e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11820 (DUF3339)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016041

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057800567.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057800567.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057800567.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057800567.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45511548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:45511637`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A20,A24,B110,B122,B32,B7,B91,C25,C42,C5,C60,C62,D7
`Chr3:45511644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B88,B9,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800567.1

70 aa

DUF3339

PF11820 DUF3339 4-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800567.1`	Pfam	`PF11820`	DUF3339	Family	4	68	1.4e-28	99.6	Protein of unknown function (DUF3339)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944584.1
TTGAGCATAAGCTCCCACATTGTGGCAAAAATTTAGCTAGGCCAAAATATTTCAAAGTGGGAAGAAATAAGAGGCAAAGATGTCGGTAGATTTGGCGCCAATTCTGATATCAGTGATATTTTTTGTGATACTGTCACCGGGGCTGTTATTCCAACTCCCCGGAAGCAAGAAGGGGATAGAGTTCGTGAACATGCGAACGAGTGGTCTCTCCATCTTCGTGCATACCATAATCTTCACTGCAATACTTTGCATCTTGCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016041
ATGTCGGTAGATTTGGCGCCAATTCTGATATCAGTGATATTTTTTGTGATACTGTCACCGGGGCTGTTATTCCAACTCCCCGGAAGCAAGAAGGGGATAGAGTTCGTGAACATGCGAACGAGTGGTCTCTCCATCTTCGTGCATACCATAATCTTCACTGCAATACTTTGCATCTTGCTTATTGCCATTGGAGTCCACATATATGTCGGATAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800567.1
MSVDLAPILISVIFFVILSPGLLFQLPGSKKGIEFVNMRTSGLSIFVHTIIFTAILCILLIAIGVHIYVG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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