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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002887`

染色体: Chr03 坐标: 45520383-45523327 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002887`
名称	SmilChr03G002887
描述	nuclear transport factor 2B-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45520383 - 45523327 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016046`
GeneID	`131016046`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016046`
原始查询	`SmilChr03G002887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transport factor 2B-like
产物	nuclear transport factor 2B-like
Arabidopsis	`AT1G27970` (NTF2B) nuclear transport factor 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839690] identity=86.2; qcov=1; evalue=2.17e-78; confidence=high
Rice	`Os08g0532300` (NTF2) - identity=68.3; qcov=1; evalue=1.37e-58; confidence=high
GO	GO:0006913 (nucleocytoplasmic transport); GO:0044613 (nuclear pore central transport channel)
KEGG	-
Pfam	PF02136 (NTF2); PF22602 (NXF_NTF2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016046

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800571.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057800571.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800571.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800571.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057800571.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45522772`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	B103,B119,B120,B124,B25,B38,B83,B91,B92,C16,C27,C40,C49,C5,C57,C6,C74,C77
`Chr3:45522774`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	B103,B119,B120,B124,B25,B38,B83,B91,B92,C16,C40,C49,C5,C57,C6,C74,C77
`Chr3:45522777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr3:45522800`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B105,B134,B33,B66,C46,C63,C64,C66
`Chr3:45522912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:45522948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:45522963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C26
`Chr3:45522981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr3:45523023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800571.1

123 aa

123

NTF2

NXF_NTF2

PF02136 NTF2 6-120 aa PF22602 NXF_NTF2 43-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800571.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	6	120	2.5e-39	135.0	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057800571.1`	Pfam	`PF22602`	NXF_NTF2	Domain	43	118	5.5e-14	53.3	Nuclear RNA export factor, NTF2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944588.1
ATGCGTGCGGGTCCCACGCCGACGAAGCAATCCCCCACATAATTAGCGTATATTTCCAGCTAAATAATACACGCTTCATTTGTTTTTCTCTTTTTTATTTATATTAAGAAAAATGAAAAATAGTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACCCCTCTGTGTGAGTGCACGATTTGAGTAATTGACTTGCGTAAAGTAGACTTAAAAAAAACGCCAAAAACAACAGAGAGGGAAAAGAGCCCGCCGCCGACCCGAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016046
ATGGATCCAGACTCTGTTGCGAAGGCATTCGTGGAGCACTACTACTCCACCTTCGATGCGAATCGCGCCGGGCTCGCCAACCTCTACCAAGACGGCTCGATGCTGACGTTTGAGGGCCAGAAAATCATGGGATCCACAAACATCGTAGCGAAGCTCACGAGTTTGCCGTTCCAGCAGTGCCAGCATCAGATTAGCACCGTTGATTGCCAGCCCTCGGGCCCCGCCGGCGGAATGCTCGTCTTCGTGTCCGGCAATCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800571.1
MDPDSVAKAFVEHYYSTFDANRAGLANLYQDGSMLTFEGQKIMGSTNIVAKLTSLPFQQCQHQISTVDCQPSGPAGGMLVFVSGNLQLAGEQHMLKFSQMFHLMPTPQGSFYVLNDIFRLNYA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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