当前解析结果
SmilChr03G002888| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002888 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002888 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002888 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 45550095 - 45553642 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016047 |
|---|---|
| GeneID | 131016047 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016047 |
| 原始查询 | SmilChr03G002888 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016047 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800572.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057800572.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057800573.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057800572.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800573.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:45550270 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A10 |
Chr3:45550270 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr3:45550280 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B25 |
Chr3:45550281 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A8,B125,C56 |
Chr3:45550281 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B125,C56 |
Chr3:45550320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr3:45550321 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr3:45550322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B8,C20,C39,D9 |
Chr3:45550333 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B86,C20,C27 |
Chr3:45550334 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr3:45550342 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr3:45550352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。