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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002893`

染色体: Chr03 坐标: 45626127-45628698 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002893`
名称	SmilChr03G002893
描述	probable phytol kinase 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45626127 - 45628698 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016052`
GeneID	`131016052`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016052`
原始查询	`SmilChr03G002893`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable phytol kinase 3, chloroplastic
产物	probable phytol kinase 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G58560` (FOLK) Phosphatidate cytidylyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835969] identity=58.4; qcov=0.836; evalue=9e-114; confidence=high
Rice	`Os01g0832000` (CDS5) - identity=63.4; qcov=0.859; evalue=3.56e-118; confidence=high
GO	GO:0016301 (kinase activity)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016052

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800585.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057800585.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800585.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800585.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45626714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr3:45626936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr3:45628382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr3:45628509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B102,B118,C33,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944602.1
GCGCCACAATAATCTCCATTTGCGGCAATGGCGTCTCTGAGTCTGACTCTTACCCGCTGGTCTAATAAACCACGTGCGCTTACCATTTTATGCAGCCAACTGCTCCTCCCAATACTCAAAACGACAGCGTTATGGCATTCGCAATCGCTTTCTTCACAATCCCCCCCAATTCCACTCCTAATTTGCGTTGTCCTTTGAGGAAAGATTGTTTCAATTTCATCCAGCTGCTCAAGCCGAAGCCGCGGAGGAGGGTCCGCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016052
ATGCAGCCAACTGCTCCTCCCAATACTCAAAACGACAGCGTTATGGCATTCGCAATCGCTTTCTTCACAATCCCCCCCAATTCCACTCCTAATTTGCGTTGTCCTTTGAGGAAAGATTGTTTCAATTTCATCCAGCTGCTCAAGCCGAAGCCGCGGAGGAGGGTCCGCCGGGAGCTGACCTCAGCGGCGGCGATGTTTTCCGACAACGTCTTTGTCAGCGACATCATCGCCGAAGCTTTGTCGGGCGGGGTTGCGCTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800585.1
MQPTAPPNTQNDSVMAFAIAFFTIPPNSTPNLRCPLRKDCFNFIQLLKPKPRRRVRRELTSAAAMFSDNVFVSDIIAEALSGGVALSLLKLWEQTAKRGVFDQKLNRKLVHITVGLAFMLCWPMFSSGRQGAIFAAIIPAVNIIKMLLIGLGIWKDDATVKSMSRYGDHRELLKGPLYYASTITLASAIYWRTSPIAIAAVCNMCAGDGMADIVGRRFGGQKLPYNQNKSVNGSIAMASAGFLASLGFMLYYSSFGFMEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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