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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002897`

染色体: Chr03 坐标: 45697650-45700954 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002897`
名称	SmilChr03G002897
描述	plastoglobule-localized metallopeptidase 48, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45697650 - 45700954 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016058`
GeneID	`131016058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016058`
原始查询	`SmilChr03G002897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastoglobule-localized metallopeptidase 48, chloroplastic
产物	plastoglobule-localized metallopeptidase 48%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G27110` (AT3G27110) Peptidase family M48 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822330] identity=82.9; qcov=0.849; evalue=2.14e-174; confidence=high
Rice	`Os01g0970700` (P0518C01.4-1) - identity=80; qcov=0.849; evalue=1.43e-169; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0071586 (CAAX-box protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF01435 (Peptidase_M48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800596.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057800596.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057800596.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057800596.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057800596.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45698016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:45699306`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A18,B13,B14,B34,B47,B61,B86,C54,C65,D1
`Chr3:45699949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B125,B16,B40,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800596.1

324 aa

162

324

Peptidase_M48

PF01435 Peptidase_M48 116-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800596.1`	Pfam	`PF01435`	Peptidase_M48	Domain	116	310	5.7e-18	66.1	Peptidase family M48

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098836.1
GAAGTGGCGGCAAACAATTACCAGGATTGCGGTTGTGGACGGAAACGTACGGCCAAATAAAACAAACGAAAACTACCCTCGTGTGTGCGCATTCCACCAATGGAACGAACGACTGCATAAGCTAACGTGCGCTCCCTTCTCTCTCTCGATCTCTGCTCTGTCCTCCTCCCATGGCTGCACTTTCTCTCTCTTCCATCAACTTCTCGGTGAAGCTTTCTCCGATTAGCTTCTGCTCTAGCGCCACAGATAGGCCGCTAATC...

XM_057944613.1
GCCAAATAAAACAAACGAAAACTACCCTCGTGTGTGCGCATTCCACCAATGGAACGAACGACTGCATAAGCTAACGTGCGCTCCCTTCTCTCTCTCGATCTCTGCTCTGTCCTCCTCCCATGGCTGCACTTTCTCTCTCTTCCATCAACTTCTCGGTGAAGCTTTCTCCGATTAGCTTCTGCTCTAGCGCCACAGATAGGCCGCTAATCACCTTTTCCGCGGGAGTTAAGCTGAAGAGTGAACGGCGGAGTAGTAATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016058
ATGGCTGCACTTTCTCTCTCTTCCATCAACTTCTCGGTGAAGCTTTCTCCGATTAGCTTCTGCTCTAGCGCCACAGATAGGCCGCTAATCACCTTTTCCGCGGGAGTTAAGCTGAAGAGTGAACGGCGGAGTAGTAATTTCGTCTGTAGAGCTGCTTCGTCCGTTGCTATTCGCGATATTGATGCAGATGATTTCAGACATCCTCTTGATCGACAAAATACGCTGATTTTGAGAGCGATTCCGGGGTTAAACGAAATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800596.1
MAALSLSSINFSVKLSPISFCSSATDRPLITFSAGVKLKSERRSSNFVCRAASSVAIRDIDADDFRHPLDRQNTLILRAIPGLNEIGKALLGSVAEQVMLLENIGTSVLVSKNQLPELHELMIEAASILNCEAPDLYLRQSPVPNAYTLAISGKKPFVVVHTSLVELLSRKELQAVLAHELGHLKCDHGVWLTFANILTLGAYSVPGLGGFIAQQLEEQLFRWLRAAELTCDRAALLVARDPKVVISVLMKLAGGCPSMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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