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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002898`

染色体: Chr03 坐标: 45700987-45704814 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002898`
名称	SmilChr03G002898
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45700987 - 45704814 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016057`
GeneID	`131016057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016057`
原始查询	`SmilChr03G002898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
产物	protein DUF642 L-GALACTONO-1%2C4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2
Arabidopsis	`AT5G14150` (AT5G14150) Emb:.1 protein, putative (Protein of unknown function, DUF642) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831265] identity=50.1; qcov=1; evalue=1.89e-120; confidence=high
Rice	`Os04g0494800` - identity=29.9; qcov=0.974; evalue=9.08e-42; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04862 (DUF642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057800595.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057800595.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057800595.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800595.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45701348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B73
`Chr3:45702179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B15,C22,C28,C51
`Chr3:45702194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B95,C59,C81
`Chr3:45702284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:45702287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:45702292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:45702302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:45702384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B15,C22,C28,C51
`Chr3:45702507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B73,B8,C47
`Chr3:45702554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B64,C24
`Chr3:45702569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:45702584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800595.1

385 aa

192

385

DUF642

PF04862 DUF642 20-179 aa PF04862 DUF642 191-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800595.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	20	179	1.2e-52	178.5	Protein of unknown function (DUF642)
`XP_057800595.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	191	356	1.2e-52	178.5	Protein of unknown function (DUF642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944612.1
GGAGAATCCCATATGATGTTTTCCATGCTAGAATGCGGAGGGCAACAGAATTCGCAAGACTCTCCGTCGCCCACCGCCGCGCAATAACTTCATCATCTCTGCACCAAACGCCACCGCCACTCTCTCTAGCGGCGGACAAATGCCAATCGATGGACCAGCTGAAGCAAATACATGCCCAGATGATTACCACCGCCCAAATTCAAGACGCCTTCGCCGCCAGCCGCCTAATCAACTTCTGCGCTCTCTCCGATTCCGGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016057
ATGAAGATAAGGACTATTTTCATCACATGCATCTGGCTAGCTATTGCTTCAGCAGATAATCTGCAGAATTCAGATTTCGAGCTCCCACCAACTAACTGGAATGAAAGCTCCTCTGCATTCTATACACTGAACGGCAGTAGCATTCCGGGATGGACACATGACGGTGCAGTGCAGTATGTCACGGCAGGAGCTGAGCTGTCGCTGCCACGAAATGGGCATGCTATACTGCTGCAAGAAGATGGCAAAATCAACCAAACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800595.1
MKIRTIFITCIWLAIASADNLQNSDFELPPTNWNESSSAFYTLNGSSIPGWTHDGAVQYVTAGAELSLPRNGHAILLQEDGKINQTFVANGEEMQYLLTFTLGRRDQNCTANASLVVSAPDSSAQFSLTLKYGKESWEVYGHQLGSWGGGESVNLVLESQDIDAEANSTCWPIVDTVMLSTMGSLKQGDDNLLPNGGFELGPAFPDFSNEGVLLDSEPSLTESALQQWTVTGTVKYIDAKNFFVPEGKAAVEIVSGVSAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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