当前解析结果
SmilChr03G002908| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002908 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002908 |
| 描述 | uncharacterized protein At3g27210-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 45837937 - 45841560 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016119 |
|---|---|
| GeneID | 131016119 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016119 |
| 原始查询 | SmilChr03G002908 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0920100; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os01g0920100; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G01860 (AT3G01860)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820070] identity=46.3; qcov=0.36; evalue=4.5e-15; confidence=low |
| Rice | Os01g0920100- identity=33.2; qcov=1.02; evalue=5.33e-26; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016119 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057800715.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057800715.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057800715.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800715.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800715.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:45838190 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr3:45838211 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:45838221 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B126,B88,C13 |
Chr3:45838221 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B126,B88,C13 |
Chr3:45838251 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C55,D8 |
Chr3:45838394 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr3:45838483 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A19,B121,B135,B136,B52,C41,C53,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。