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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002911`

染色体: Chr03 坐标: 45859721-45861379 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002911`
名称	SmilChr03G002911
描述	protein LYK2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45859721 - 45861379 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016103`
GeneID	`131016103`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016103`
原始查询	`SmilChr03G002911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LYK2
产物	protein LYK2
Arabidopsis	`AT3G01840` (LYK2) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820047] identity=38; qcov=1.09; evalue=2.92e-69; confidence=medium
Rice	`Os01g0601200` (OsRLCK41) - identity=31.1; qcov=0.847; evalue=9.5e-31; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016103

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800671.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800671.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800671.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800671.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45860094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B5,B83,C59
`Chr3:45860102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B39,B4
`Chr3:45860161`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B130,B73,D7
`Chr3:45860161`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B130,B73,D7
`Chr3:45860192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B22,B23,B77,C9
`Chr3:45860226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:45860268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C45
`Chr3:45860379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:45860381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C38,C44
`Chr3:45860692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:45860751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C33
`Chr3:45860823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800671.1

353 aa

176

353

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 100-345 aa PF00069 Pkinase 102-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800671.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	100	345	5.3e-23	82.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057800671.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	102	343	2.4e-18	67.2	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944688.1
TAATTTGTTTAATTAATCTCGATGAATATTCATTGTCACATTTATGAATGCATAAAGAAATACAGTTGCAGCTAAATCCAAGATTTCTGTCGCCAAGTCGACCCCTTGTAATTCTGTGCAATTTCCTGGTTATAGATCCAAAAATATTCAGTCCCCACTCTCGAAATCCAGATAATTTTCATTATTCTAACTAGGCACTCAAATTAATTGGATTTAGTGTCACATAAACTAGAAAAACATGATCTCATTTTCTTATATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016103
ATGTGGATGACAGCAGATTATGTAGGCATCGCGGCGGCTGGGATTCTGCTCATCACCGCCATCATAGCAACCATTTTGTTTCTGATGAAGAACATGACCAGGAGAGAGAATTCAATGAAGCAGGAAGCCGATTCGGAGCTGCAGAGACTCAGCTTAAGCTTCCGAACCGCAACCGACAACAAAGTCTCCTTCGACGGATCTCACGACGATCCAACCCCCCACGCCCACGCCCAAAACTACAAATTCGAACATCTGCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800671.1
MWMTADYVGIAAAGILLITAIIATILFLMKNMTRRENSMKQEADSELQRLSLSFRTATDNKVSFDGSHDDPTPHAHAQNYKFEHLQKATQYFSSSNLISGAVYRGRLDGEDVAIRRLPTHVVSRIEFHLAQQSIIEHPNIIRVLGTCTPDANAPDSFLVIEYASNGSLRDWIHGGLAIKNQFIASCDRLLNWNQRLKICADAANAMHFLHDAVNLFHIRLNVGNIFLDHEFNAKICVSLESKNDREEGWLAPEYVRERVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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