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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002916`

染色体: Chr03 坐标: 45911838-45916057 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002916`
名称	SmilChr03G002916
描述	WEB family protein At5g16730, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45911838 - 45916057 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016070`
GeneID	`131016070`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016070`
原始查询	`SmilChr03G002916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WEB family protein At5g16730, chloroplastic
产物	WEB family protein At5g16730%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G27595` (AT4G27595) WEB family protein (DUF827) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828870] identity=42.1; qcov=0.829; evalue=7.73e-131; confidence=medium
Rice	`Os02g0439200` - identity=33.8; qcov=0.687; evalue=6.94e-67; confidence=low
GO	GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination)
KEGG	-
Pfam	PF05701 (WEMBL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016070

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800627.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057800627.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057800627.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800627.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45912584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:45913227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:45913469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:45913499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:45913548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B2,C58
`Chr3:45913730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr3:45914112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:45914134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B64,C24
`Chr3:45914174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:45914210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C75
`Chr3:45914253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:45914549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800627.1

905 aa

452

905

WEMBL

PF05701 WEMBL 76-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800627.1`	Pfam	`PF05701`	WEMBL	Coiled-coil	76	541	1.5e-14	54.4	Weak chloroplast movement under blue light

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944644.1
TTCTTTTTTTTCTTGAATTTTATTCCAAGAAATAATAGTGCTCTTATCTTAATAAACAGAGCTGCAACAATAAAAAAAACAATGAATTATGTCTTCTTCCCAACAAAGTTTCCAAATTAAAACCAAATCTAGAAATTAATCTGAGCTCACAATGCAGAATCTCCACATAACAAAATAGAAAAGTAAATAGTTTTCAATCTTGCTTGATTAAAGTTTCTCTCTTTCTTGAGAGCTCTTTATCCACTTTTTAAGCTGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016070
ATGTCTGCTAAATCGAAATCTAGTTTATCTGGAACTCCAAATGCTAAAGCATCACCGGCAACTCCTCGAAGCAGCAGGGGAGTTGCTAGACCTAGTGGTGACTCGATTTCCTCGTTGCAAAATGGCCGCCTCTCCATTGATAGATCCCCGGGATCTCTCACTCCCAAGCCTAAAGTGGAGAGGGCGTCGCCCAAGCCCAGCACTCCGACTGATAGGAAGCCAACGCGTATGGTGAGGCCGTCTTCAGAGCTTCAGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800627.1
MSAKSKSSLSGTPNAKASPATPRSSRGVARPSGDSISSLQNGRLSIDRSPGSLTPKPKVERASPKPSTPTDRKPTRMVRPSSELQAELNQAQEDLKKANEKLVSVEKEKVKALDEVKEAHRLCNEANEKLEEALQAQRRAEENSEIEKFRALEMEQVGFGANPMKEDEWQKELEAVRSQHAVDVAALLSATQELQKVKQELAMTSAAKNQALNHADDATKIAEIHAEKVELLSAEVIRLKSALESRVEMQAVENNQLVSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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