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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002918`

染色体: Chr03 坐标: 45931901-45934424 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002918`
名称	SmilChr03G002918
描述	cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45931901 - 45934424 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016108`
GeneID	`131016108`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016108`
原始查询	`SmilChr03G002918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6
产物	cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6
Arabidopsis	`AT2G23910` (AT2G23910) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816923] identity=45.7; qcov=0.98; evalue=3.86e-83; confidence=high
Rice	`Os10g0576900` (OsCCR3) - identity=52.3; qcov=0.987; evalue=1.46e-98; confidence=high
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016108

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057800699.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800699.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057800699.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800699.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800699.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45932682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:45932924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B130,B72,C1,C50
`Chr3:45932993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:45933862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C20,C4
`Chr3:45934146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B130,B9,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800699.1

306 aa

153

306

NmrA

3Beta_HSD

Epimerase

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 10-129 aa PF01073 3Beta_HSD 15-173 aa PF01370 Epimerase 17-190 aa PF13460 NAD_binding_10 18-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800699.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	10	129	1.1e-08	35.8	NmrA-like family
`XP_057800699.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	15	173	4.7e-08	33.1	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057800699.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	17	190	2.4e-08	34.4	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057800699.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	18	133	2.1e-09	38.2	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944716.1
ATAATTGTATTTTGTTGTTTGCCTTGCCTATGACTAACTACCACCTTCCCAACCATCTGCTAACCACACACTCTTTCAATGCTCTAAACTTTCTTTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTAAATACCCACACCCCTTCGCCAATCCCACAACTCCATTTCTCTCTCTCTCTAAAACCCCTCCACATTGTTGGCATCCCTCCCACTCGGTGCATTGCGTGCTTTCCGCAATGGCGCCAGCTTCTTTCTGGAACTCATCTAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016108
ATGGCGCCAGCTTCTTTCTGGAACTCATCTAAAACTGTCTGCGTCATGGATGCCTCCGGCCGCCTCGGCTCCGCCCTCGTTCACCGCCTCCTCAATCGCGGTTACACCGTTCACGCCGCCGTCCACAGCCACGATGAGATGCAGCGGTACAAGAGGCAATCGATGGAGAAGAAGGAGCTGAGAGTATTTCATTCGGATCCATTGGATTATCACAGCATTTTGGATGCTCTCAAAGGCTGCTGCGCCTTGTTCTACTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800699.1
MAPASFWNSSKTVCVMDASGRLGSALVHRLLNRGYTVHAAVHSHDEMQRYKRQSMEKKELRVFHSDPLDYHSILDALKGCCALFYSFELPSDHPTYDEFMGELEVRAAHNVLEACAQTDTIDKVVFTSSATAVVWREHDDGRTSDIDERNWSNVNFCKKFKLWHGLSKTVAEKTAWALAMDREVNMVSINAGLLMYPDLSIKDPYLLGAAEMFKDGVLVTVDLEFLIDAHICVFEDVSSYGRYLCFNGIINCNDDVVKLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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