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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002928`

染色体: Chr03 坐标: 46035383-46036956 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002928`
名称	SmilChr03G002928
描述	transcription factor MYB39
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46035383 - 46036956 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016104`
GeneID	`131016104`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016104`
原始查询	`SmilChr03G002928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB39
产物	transcription factor MYB39
Arabidopsis	`AT5G16770` (MYB9) myb domain protein 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831540] identity=42.5; qcov=1.07; evalue=1.12e-76; confidence=medium
Rice	`Os06g0221000` - identity=59.3; qcov=0.532; evalue=6.54e-68; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016104

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800672.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800672.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800672.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800672.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800672.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46036265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B72,C1
`Chr3:46036293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C26
`Chr3:46036334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C26
`Chr3:46036436`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C47
`Chr3:46036436`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C47
`Chr3:46036552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:46036762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:46036889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800672.1

333 aa

166

333

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 12-59 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 15-74 aa PF00249 Myb_DNA-binding 65-109 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 68-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800672.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	12	59	2.5e-37	127.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057800672.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	15	74	1.6e-21	76.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057800672.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	65	109	2.5e-37	127.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057800672.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	68	116	1.6e-21	76.9	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944689.1
ACACAAAACTGACTCATGTTCATCTAAAATTGCTCAAGACACACACACAACACGATGGAAATGACGACAGAAGAAAATGGCTTAAAGAAAGGGCCGTGGACACCTGAAGAAGACCGGATGCTCGTTGACTGCATTCAGAAACACGGCCATGGCAGCTGGAAAGAGCTGCCAAAGCTTGCGGGGCTCAATAGGTGCGGGAAGAGCTGCCGCCTGCGTTGGACAAATTATCTCCGCCCCGATATCAAGAGAGGAGCCTTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016104
ATGGAAATGACGACAGAAGAAAATGGCTTAAAGAAAGGGCCGTGGACACCTGAAGAAGACCGGATGCTCGTTGACTGCATTCAGAAACACGGCCATGGCAGCTGGAAAGAGCTGCCAAAGCTTGCGGGGCTCAATAGGTGCGGGAAGAGCTGCCGCCTGCGTTGGACAAATTATCTCCGCCCCGATATCAAGAGAGGAGCCTTTACTGACGAGGAAGAAAGGGTCATTATCGATCTTCATGCAGAGCTAGGCAACAAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800672.1
MEMTTEENGLKKGPWTPEEDRMLVDCIQKHGHGSWKELPKLAGLNRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGAFTDEEERVIIDLHAELGNKWSVIASYLPGRTDNEIKNFWNTRLKKKLLRNGIDPDTHMPRTHLDTLLPVLPQLLSYNSSRNLTWEGIVRSQEDAARLAKVLLVGNILQLLNTGTTSVLPPVAMETFSPSLGSAQVTNRPPWDSHMMGLQLERFTQKPEFDALTCQPSFKDALRPVFQNTMETNNVMDINSNKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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