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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002936`

染色体: Chr03 坐标: 46090225-46093349 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002936`
名称	SmilChr03G002936
描述	uncharacterized SmilChr03G002936
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46090225 - 46093349 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016125`
GeneID	`131016125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016125`
原始查询	`SmilChr03G002936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0652900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0652900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G16870` (AT5G16870) Peptidyl-tRNA hydrolase II (PTH2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831550] identity=68; qcov=0.962; evalue=3.78e-79; confidence=high
Rice	`Os04g0652900` - identity=78.2; qcov=0.795; evalue=1.89e-79; confidence=high
GO	GO:0004045 (peptidyl-tRNA hydrolase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF01981 (PTH2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800725.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057800725.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800725.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800725.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46092733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B137,C73
`Chr3:46092750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B26,D4
`Chr3:46092793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:46092907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A19,B137,C24,C73
`Chr3:46092907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B137,C24,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800725.1

194 aa

194

PTH2

PF01981 PTH2 81-194 aa

XP_057800726.1

185 aa

185

PTH2

PF01981 PTH2 72-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800725.1`	Pfam	`PF01981`	PTH2	Family	81	194	2.1e-42	144.7	Peptidyl-tRNA hydrolase PTH2
`XP_057800726.1`	Pfam	`PF01981`	PTH2	Family	72	185	1.8e-42	144.9	Peptidyl-tRNA hydrolase PTH2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944742.1
AAAGAAAATGAGGGGTCTAAGTAAAGGATCGTTTGACTCTATTCCAAAACTTTAGCAAATTTTAGTAAGGGAAACCGCTCAAAATTGCGCAAAGCCAAACAGCGTCCTATTCCCAGCCTGAAATCTGTGAATTTCCATTTCCCCATTACTTCTCTGTCCTCTCTCATAGGCTAAAATCTTCTTCTCCGCACCGAGACGCCGTCGTATCTTTCCCCCTCTAGCTCAGGAGTCTGGACACACTCTTCATCATGACAGTAACA...

XM_057944743.1
GGAAACCGCTCAAAATTGCGCAAAGCCAAACAGCGTCCTATTCCCAGCCTGAAATCTGTGAATTTCCATTTCCCCATTACTTCTCTGTCCTCTCTCATAGGCTAAAATCTTCTTCTCCGCACCGAGACGCCGTCGTATCTTTCCCCCTCTAGCTCAGGAGTCTGGACACACTCTTCATCATGACAGTAACAGAGTGCTGCGATGGGGTTTGATATGATAGGGATGACTTGGCTTAGCGTATTCTTAATTGGGGCGGGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016125
ATGACAGTAACAGTGCAGAGTGCTGCGATGGGGTTTGATATGATAGGGATGACTTGGCTTAGCGTATTCTTAATTGGGGCGGGCTGTTTTGCTCTAGGATGCCTAATCGGTGCCCGGCGTTCCTACCACGCCGCTTTGCGTTTGTCAAAATGTGCTGAGGTTAACGATGAAGGGAGGAAGAAGGTTAATCGGGGTAAACCACAGCTCGAGGTTGAAAAACTAGCTGAAATTATCGACGATTTTAAGATGGTATTGGTTGT...

LOC131016125
ATGGGGTTTGATATGATAGGGATGACTTGGCTTAGCGTATTCTTAATTGGGGCGGGCTGTTTTGCTCTAGGATGCCTAATCGGTGCCCGGCGTTCCTACCACGCCGCTTTGCGTTTGTCAAAATGTGCTGAGGTTAACGATGAAGGGAGGAAGAAGGTTAATCGGGGTAAACCACAGCTCGAGGTTGAAAAACTAGCTGAAATTATCGACGATTTTAAGATGGTATTGGTTGTGAGGAATGACCTGAAAATGGGGAAGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800725.1
MTVTVQSAAMGFDMIGMTWLSVFLIGAGCFALGCLIGARRSYHAALRLSKCAEVNDEGRKKVNRGKPQLEVEKLAEIIDDFKMVLVVRNDLKMGKGKIAAQCSHATLGLYKKILNRAPKSLSRWEMCGQVKVVVKIESEDDMLVLQERAKSLNLPTHVTIDAGRTQIAPNSRTVMAVLGPADLVDDVTGGLKLL

XP_057800726.1
MGFDMIGMTWLSVFLIGAGCFALGCLIGARRSYHAALRLSKCAEVNDEGRKKVNRGKPQLEVEKLAEIIDDFKMVLVVRNDLKMGKGKIAAQCSHATLGLYKKILNRAPKSLSRWEMCGQVKVVVKIESEDDMLVLQERAKSLNLPTHVTIDAGRTQIAPNSRTVMAVLGPADLVDDVTGGLKLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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