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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002937`

染色体: Chr03 坐标: 46095005-46098313 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002937`
名称	SmilChr03G002937
描述	TOM1-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46095005 - 46098313 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016100`
GeneID	`131016100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016100`
原始查询	`SmilChr03G002937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TOM1-like protein 1
产物	TOM1-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G16880` (AT5G16880) Target of Myb protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831551] identity=71.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0697300` (tom1) - identity=70.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00790 (VHS); PF03127 (GAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800663.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057800663.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057800663.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800663.1`
5	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057800663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46096094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr3:46096482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:46096554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr3:46097861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:46097934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr3:46097990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C8
`Chr3:46098005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B37,B77,C26,C8
`Chr3:46098149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800663.1

394 aa

197

394

VHS

GAT

PF00790 VHS 47-179 aa PF03127 GAT 235-308 aa

XP_057800664.1

394 aa

197

394

VHS

GAT

PF00790 VHS 47-179 aa PF03127 GAT 235-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800663.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	47	179	3.6e-24	86.0	VHS domain
`XP_057800663.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	235	308	4.5e-19	69.1	GAT domain
`XP_057800664.1`	Pfam	`PF00790`	VHS	Repeat	47	179	3.6e-24	86.0	VHS domain
`XP_057800664.1`	Pfam	`PF03127`	GAT	Domain	235	308	4.5e-19	69.1	GAT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944680.1
GATACAGACATACAGCAATTATTTTCTTTCATTTTCTTGTAGTTGACTTAGGAACTTGGGAGAGATACAACAAATATTTATCTACAAATTAATTTAAAATTGTATATATAAGTTGGAGGGAGGCCTGCAGCTCTTGGAAGATTCCGCTGTGGAAAAAAGCCTCCAAAAAAGTCTTATGTTAAAACTGAAGAGTCGTCACACATAACACGCAAAAACCTCACTTTAAGCAAGTCTTCTTTCTTCTCCAAAATTTTTTTTGC...

XM_057944681.1
CAGACATACAGCAATTATTTTCTTTCATTTTCTTGTAGTTGACTTAGGAACTTGGGAGAGATACAACAAATATTTATCTACAAATTAATTTAAAATTGTATATATAAGTTGGAGGGAGGCCTGCAGCTCTTGGAAGATTCCGCTGTGGAAAAAAGCCTCCAAAAAAGTCTTATGTTAAAACTGAAGAGTCGTCACACATAACACGCAAAAACCTCACTTTAAGCAAGTCTTCTTTCTTCTCCAAAATTTTTTTTGCCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016100
ATGAGTGACAATTTGATGGAGAAAGTCAGCGCTTTTGGTGAGCGCTTAAAGATCGGGGGATCTGAGGTGGGGCAAAAGATTACTGCGGGCGTGAGCTCTGTTAGTTTCAAGATGAAGGAATTCTTCCAAGGTCCGAATCAGGCTGATAAGCTTGTTGAGGAAGCCACTGCCGAAACTCTTGACGAGCCTGATTGGGCCACGAATCTTGAACTTTGTGATATGATCAATCATGAGAGGGTCAGCAGTGTTGAGTTGATCAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800663.1
MSDNLMEKVSAFGERLKIGGSEVGQKITAGVSSVSFKMKEFFQGPNQADKLVEEATAETLDEPDWATNLELCDMINHERVSSVELIRGIKKRIVLKSPRIQYLALVLLETVAKNCEKAFSEIAAERVLDEMVKLIDDPQTVVNNRNKALILIESWGESSNELRYLPVYEETYKSLKSRGVRFPARDEESLAPIFTPARSVEASQPNATLGQQLHYDIPVQSFSAEQIKEAFDVARNSIELLSTVLSSSPQQDALEDELTT...

XP_057800664.1
MSDNLMEKVSAFGERLKIGGSEVGQKITAGVSSVSFKMKEFFQGPNQADKLVEEATAETLDEPDWATNLELCDMINHERVSSVELIRGIKKRIVLKSPRIQYLALVLLETVAKNCEKAFSEIAAERVLDEMVKLIDDPQTVVNNRNKALILIESWGESSNELRYLPVYEETYKSLKSRGVRFPARDEESLAPIFTPARSVEASQPNATLGQQLHYDIPVQSFSAEQIKEAFDVARNSIELLSTVLSSSPQQDALEDELTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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