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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002940`

染色体: Chr03 坐标: 46123485-46124282 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002940`
名称	SmilChr03G002940
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46123485 - 46124282 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018878`
GeneID	`131018878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018878`
原始查询	`SmilChr03G002940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=38.5; qcov=0.964; evalue=6.6e-40; confidence=medium
Rice	`Os06g0226000` (P0690H04.13-1) - identity=47.4; qcov=0.902; evalue=1.69e-52; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803556.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803556.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803556.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803556.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46123486`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A13,B107,B123,B137,B3,B31,B62,C18,C25,C29,C37,C44,C46,C48,C70
`Chr3:46123487`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A10,A14,A16,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A4,A5,B1,B102,B105,B106,B108,B109,B110,B112,B114,B115,B118,B120,B121,B122,B124,B125,B129,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B18,B19,B22,B23,B24,B32,B34,B4,B41,B44,B45,B46,B49,B52,B56,B58,B63,B64,B65,B67,B68,B7,B71,B75,B76,B78,B79,B8,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B96,B97,C12,C15,C20,C21,C23,C28,C31,C33,C36,C38,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C5,C50,C52,C53,C57,C60,C62,C7,C71,C73,C76,C77,C78,C80,C84,C9,D10,D11,D5,D9
`Chr3:46123492`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A1,A2,A25,B1,B10,B102,B105,B106,B11,B12,B121,B13,B137,B138,B2,B21,B26,B35,B36,B37,B43,B47,B63,B78,B89,C12,C22,C23,C26,C28,C3,C39,C45,C51,C59,C64,C66,C70,C74,C82
`Chr3:46123495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B127,B33,C27,C87
`Chr3:46123511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C8
`Chr3:46123522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C18,D10
`Chr3:46123562`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	65	A1,A10,A13,A18,A2,A8,B1,B102,B105,B106,B11,B113,B121,B122,B129,B13,B132,B138,B15,B18,B19,B2,B21,B26,B27,B34,B35,B36,B37,B42,B43,B44,B47,B55,B67,B8,B83,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B97,B99,C12,C23,C3,C36,C39,C45,C46,C48,C51,C54,C59,C64,C66,C70,C74,C77,C82,D10,D5
`Chr3:46123583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C48
`Chr3:46123589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A13,A14,A20,A24,A3,A5,B100,B103,B105,B106,B110,B111,B113,B117,B118,B120,B123,B124,B128,B129,B130,B138,B139,B16,B17,B20,B29,B30,B31,B32,B45,B65,B69,B7,B81,B90,B91,B92,C1,C13,C18,C20,C25,C28,C30,C31,C38,C39,C42,C49,C5,C50,C52,C55,C57,C60,C62,C7,C73,C77,C83,C84,C9,D10,D11,D6,D7
`Chr3:46123629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A16,A20,A23,B101,B109,B112,B115,B120,B123,B134,B137,B14,B140,B24,B31,B4,B41,B46,B56,B58,B63,B68,B70,B71,B76,B78,B8,B84,B87,B93,B96,C15,C31,C37,C38,C4,C43,C50,C57,C60,C76,D9
`Chr3:46123666`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A1,A10,A13,A15,A18,A19,A21,A25,A4,A8,B1,B10,B102,B108,B11,B114,B121,B122,B125,B129,B132,B135,B136,B15,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B29,B34,B35,B36,B37,B42,B43,B44,B47,B49,B5,B52,B55,B57,B61,B64,B67,B7,B75,B79,B83,B85,B86,B9,B97,B99,C12,C14,C16,C22,C23,C26,C27,C3,C33,C36,C39,C41,C44,C45,C46,C48,C51,C53,C54,C58,C59,C64,C71,C74,C77,C78,C80,C82,C84,C85,D1,D10,D11,D5
`Chr3:46123695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803556.1

194 aa

194

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

PF13359 DDE_Tnp_4 13-173 aa PF01609 DDE_Tnp_1 25-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803556.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	13	173	5.4e-20	72.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057803556.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	25	172	6.8e-06	26.7	Transposase DDE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947573.1
ATGTGGTGTTGGTTCAAGGGTTGTTTGGGTGCTCTTGATGGTAGTTACATTAATTTAATGGTCAGTAACGTTGACAAGCCGATATACTGTACCCGTAAAGGGCAGATTGCAACAAATACCCTTGCCGTTTGTGACCGCAATATGCAGTTCGTCGACGTGTTACCCGGATGGGAAGGCTCAGCCGTGGATTCGAGGATTTTGCGCGATGCCCTACAACGTGCAAATGGATTGAGGGTGCCCAAAGGCAACTACTATCTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018878
ATGTGGTGTTGGTTCAAGGGTTGTTTGGGTGCTCTTGATGGTAGTTACATTAATTTAATGGTCAGTAACGTTGACAAGCCGATATACTGTACCCGTAAAGGGCAGATTGCAACAAATACCCTTGCCGTTTGTGACCGCAATATGCAGTTCGTCGACGTGTTACCCGGATGGGAAGGCTCAGCCGTGGATTCGAGGATTTTGCGCGATGCCCTACAACGTGCAAATGGATTGAGGGTGCCCAAAGGCAACTACTATCTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803556.1
MWCWFKGCLGALDGSYINLMVSNVDKPIYCTRKGQIATNTLAVCDRNMQFVDVLPGWEGSAVDSRILRDALQRANGLRVPKGNYYLCDNGYANNEGFLAPYKGIHYHLKEWGPNASRPQNAMELFNLRHSKAHNVIERALWILKMRWGILRSSVFYPVKTQIRLIMSCFILNNFIQSEMPDDPIEREFDSVPEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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