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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002945`

染色体: Chr03 坐标: 46191717-46194150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002945`
名称	SmilChr03G002945
描述	uncharacterized SmilChr03G002945
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46191717 - 46194150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016113`
GeneID	`131016113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016113`
原始查询	`SmilChr03G002945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800705.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800705.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800705.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800705.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46191811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B23
`Chr3:46191823`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	61	B10,B100,B101,B103,B109,B111,B113,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B127,B131,B135,B138,B16,B18,B2,B28,B30,B32,B37,B42,B47,B5,B50,B51,B6,B67,B69,B71,B78,B8,B83,B86,B91,B92,B94,B95,B99,C11,C24,C31,C34,C35,C5,C54,C59,C63,C65,C67,C68,C71,C74,C82,C83,C87,D1,D9
`Chr3:46191831`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B138,B73,B93,C52,C60,C61,C78
`Chr3:46191838`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B10,B121,B28,C54
`Chr3:46191838`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B10,B121,B28,C54
`Chr3:46191845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C28,C39
`Chr3:46191877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B140,B31
`Chr3:46191906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B101,B113,C62
`Chr3:46191921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C8
`Chr3:46191966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:46191976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:46191978`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A2,B20,B50,B60,C39,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800705.1

258 aa

129

258

DUF8566

PF29561 DUF8566 166-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800705.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	166	225	3.9e-16	60.2	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944722.1
TCCAACTCGCCGATCGAAACTATGGACGGCGGTCGAAGGTGGTTTCCGGCGTTGTACTGTGCAAGTAGAAGGTGGTTTCTGACGTTGATTTGTGCAATTCGAAGGCTTTTTCCGGTGCCGATTTGTGCAATTCGAAGGCCGTTTCCGACGCCGATTTGTGCAAGTCGAAGGCGGTTTTCGGCGCCAATCATTGCAAGGAGACGGCGGAGGCAATTGAATAGGAACTGTGCAAGACGTAGGCGAGTCTATAGCAAGCGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016113
ATGTTGATTTTTCCTACATTCGTATGTAGATATATGTTAACTAATATTATTTTATTTTTACAAGATAACAATGGTGAACGACTAAGGGAATTCTACAACATTTTAGCTGAAAAAGTTGTAGAAAATATTGTAAAAAATCGTGTGAAAGATGTGAGTAGCTCAAAACGTAAAGAAAATGATGGCCCAAGTAGTGGGGGAATTGAAACTGATGATCCAAAAGTTAATGCGGCTACAATTATTGATGAGTGTGTGCAAGCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800705.1
MLIFPTFVCRYMLTNIILFLQDNNGERLREFYNILAEKVVENIVKNRVKDVSSSKRKENDGPSSGGIETDDPKVNAATIIDECVQATMMKNKGKEKANTSSADTRINEPRVINARKAVVRKINTTLSIHDDDFVEDGLNTKQMSVNVGDEGPVEKEAKNHHMLRSRGSPSYLQKLISSLNDAQKEAVRQIGFGDFLHLQINELTTKLTYWVVKNFDSKELSIQLCNVHHTNLSMQPKNKQLSNLNPYYAVKFCNYATH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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