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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002956`

染色体: Chr03 坐标: 46307575-46311771 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002956`
名称	SmilChr03G002956
描述	protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46307575 - 46311771 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016123`
GeneID	`131016123`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016123`
原始查询	`SmilChr03G002956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY-like
产物	protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY-like
Arabidopsis	`AT5G17210` (AT5G17210) transmembrane protein, putative (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831585] identity=60.1; qcov=0.925; evalue=2.77e-70; confidence=high
Rice	`Os06g0114700` - identity=63.5; qcov=0.952; evalue=2.06e-73; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06749 (DUF1218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016123

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800722.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057800723.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057800723.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800722.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46307899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:46307919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C76
`Chr3:46307936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C4,C43,C65
`Chr3:46307939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B50,C33
`Chr3:46307945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B9
`Chr3:46307955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:46307964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:46307990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:46308130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B101,B115,B78,B8
`Chr3:46308163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C76
`Chr3:46308794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr3:46308863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800722.1

212 aa

106

212

DUF1218

PF06749 DUF1218 58-151 aa

XP_057800723.1

187 aa

187

DUF1218

PF06749 DUF1218 33-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800722.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	58	151	2.3e-30	105.6	Protein of unknown function (DUF1218)
`XP_057800723.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	33	126	1.4e-30	106.3	Protein of unknown function (DUF1218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944739.1
TTTGTGAACCCAAAATGACAAATGGGTCATATTAAATGGGACGGAAGGAATACATCTTAATCTTTCCAACACGCATCAATCTTGTTAAGTGAAAAAAAATGAAAAGGCGAATAAATGATAAATTTTTTGCTCAATAAGTAAATGTTCTAAAATAGATGAAACGCTAAAAAAAAGTGTTTCAATATAAGTGGAACGGATGGAGTAATTGATACAATTGCTAAAAATTGAAATATAATTAATACTAAATTTTAAAAATTGTG...

XM_057944740.1
TTCATTCGTATGTTTTTTAGTTCTTTACACTATTTTTGTTAGACATTTCTAGATTTTGTAGGTATCAAAATAAAAAAATCATTTCTTTTTTCATTAATTTTTGTTATTTCCTTTTCAAAGAATGATAATCTGCTGTAGGGATATGCTTCTTGCTAGCTAATTCAAGTAGGGCTTTTATGTCCTTAAATTCAAGGCTCTATTTATGTAGTTTTTAGCCCAAAGGTTTCACTCTATGCTAGAGTAGGAATTTAAGGATCAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016123
ATGGAGAGACGGGTGATTATAGTGTGCTGTGTTGTGGGGTTTCTTGGGTTGTTGTCTGCTGCTACAGGCTTCGCCGCTGAGGCTAAGAGGATTAAGGGTAGCCAAGTCCTGTTTCCATCCCCTTCTATATGTGTATATCCGAGGAGCCCTGCACTAGTCCTCGGGTTAACTGCAGCTGTCTCTCTCATGATTGCTCAAATTATCATCAATGTTGCAACTGGATGCATTTGTTGTAGGAAAGGCTCTCATCAATCAAGCTC...

LOC131016123
ATGAATGTGTCATTTTCGATGGGTAGCCAAGTCCTGTTTCCATCCCCTTCTATATGTGTATATCCGAGGAGCCCTGCACTAGTCCTCGGGTTAACTGCAGCTGTCTCTCTCATGATTGCTCAAATTATCATCAATGTTGCAACTGGATGCATTTGTTGTAGGAAAGGCTCTCATCAATCAAGCTCTAGTTGGAGTGTAGCACTTGTGTGCTTTGTCGTCTCCTGGTTCACCTTCGTCATCGCATTCCTTCTGTTGCTCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800722.1
MERRVIIVCCVVGFLGLLSAATGFAAEAKRIKGSQVLFPSPSICVYPRSPALVLGLTAAVSLMIAQIIINVATGCICCRKGSHQSSSSWSVALVCFVVSWFTFVIAFLLLLTGAALNDQHGEENLYFGNYYCYVVKPGVFAGAAVLSLASVTLGIFYYLTLTSGKDRNETWGAPVPPSRGAIAMGQPQFPPQNAEAPPVFVHEDTYMRRQFT

XP_057800723.1
MNVSFSMGSQVLFPSPSICVYPRSPALVLGLTAAVSLMIAQIIINVATGCICCRKGSHQSSSSWSVALVCFVVSWFTFVIAFLLLLTGAALNDQHGEENLYFGNYYCYVVKPGVFAGAAVLSLASVTLGIFYYLTLTSGKDRNETWGAPVPPSRGAIAMGQPQFPPQNAEAPPVFVHEDTYMRRQFT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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