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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002958`

染色体: Chr03 坐标: 46350100-46352683 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002958`
名称	SmilChr03G002958
描述	late embryogenesis abundant protein At5g17165
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46350100 - 46352683 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016133`
GeneID	`131016133`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016133`
原始查询	`SmilChr03G002958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein At5g17165
产物	late embryogenesis abundant protein At5g17165
Arabidopsis	`AT3G03150` (AT3G03150) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821070] identity=53.7; qcov=0.683; evalue=6.82e-24; confidence=medium
Rice	`Os04g0598000` - identity=47.3; qcov=0.917; evalue=1.72e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF22272 (LEA_3b)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800742.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057800742.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800742.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800742.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46352228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:46352288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B50,C33
`Chr3:46352360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:46352453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800742.1

120 aa

120

LEA_3b

PF22272 LEA_3b 36-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800742.1`	Pfam	`PF22272`	LEA_3b	Family	36	116	5.8e-31	107.5	Late embryogenesis abundant protein (LEA_3b subfamily)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944759.1
GACAGTCAACTTCTGTTTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCATTACACACACTATCCACTGCCCCTCTATATAAAAAGGGGTCCCCCAGTTTCAATTCCTCCCAATAACTTGGCTTTCTCTCTCAACTCTTCCCACTCTCTCTAGAATTTATTGAAACCTCCCTCTCTCTCTCCGCAAAGACTGTGAGTGATATTTGTATGGCCGCTAATTTGCAGCGCACTCGTGGACTGGCGAAATTGGGCAAAAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016133
ATGGCCGCTAATTTGCAGCGCACTCGTGGACTGGCGAAATTGGGCAAAAGATTAGCTGGCCAGATCCGCTCTCGCGATTCCCTCGCCATTTCTCAGCTCCACTGCAGGAGTGTGCAAGCTTCAGCCTACGACAAGAACCCGGAGGAGAATGTGAACTCGACTGTGGTCCCGGACCATGTAATCCCGCCTCAGCCGGACGAGTACTGGGCTCCTCATCCTAAGACAGGGGTGTTCGGGCCTGCAACGGATGAGAATCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800742.1
MAANLQRTRGLAKLGKRLAGQIRSRDSLAISQLHCRSVQASAYDKNPEENVNSTVVPDHVIPPQPDEYWAPHPKTGVFGPATDENPGSGHNPGAANGGSVLEEKAFFRPQEDLDKPPVQP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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