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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002963`

染色体: Chr03 坐标: 46390127-46392572 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002963`
名称	SmilChr03G002963
描述	60S ribosomal protein L13-1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46390127 - 46392572 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016124`
GeneID	`131016124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016124`
原始查询	`SmilChr03G002963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L13-1
产物	60S ribosomal protein L13-1
Arabidopsis	`AT3G49010` (BBC1) breast basic conserved 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824062] identity=84.3; qcov=0.927; evalue=4.18e-121; confidence=high
Rice	`Os06g0115500` - identity=79.7; qcov=0.956; evalue=3.71e-116; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01294 (Ribosomal_L13e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800724.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800724.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800724.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800724.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46391184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:46391891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:46391922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C20,D10
`Chr3:46391948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr3:46392003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:46392152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:46392158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B43
`Chr3:46392204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C8
`Chr3:46392253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B38,B39
`Chr3:46392291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800724.1

206 aa

103

206

Ribosomal_L13e

PF01294 Ribosomal_L13e 6-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800724.1`	Pfam	`PF01294`	Ribosomal_L13e	Family	6	184	3.7e-78	262.2	Ribosomal protein L13e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944741.1
ACTAAAGCATATACATTTGAGGTGAGAGAGAGCCCATTATCACAAACATCAATTGGACAAACGGGCCCAATTCCTAACTCTTCTAACATAACAGGATTTTTCAGTTACAATTTCTGGGCCCAAAACCCGTCCAAAACCTAGGGTTTCTGGCGCTCTATATAAAAGAAGAGGCGCCCATTTCTCAATGGAATTTGCAGCAGTACAGAGCTAGGAGGAGCTCCCCGTCGTCCGCCCTGCTCATCACCGACGCTGTAAACCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016124
ATGAAGCACAACAATGTTATTCCCAACGGGCACTTCAAGAAACATTGGCAAAACTATGTGAAGACTTGGTTTAATCAGCCTGCCCGCAAGGCCAGAAGAAGAAATGCGAGGCAGCAGAAGGCGATCAAGATTTTTCCCAGGCCCACAGCTGGGCCACTTCGTCCAGTCGTACGTGGCCAGACACTAAAATACAACATGAAGGTCAGAGCTGGTAGGGGATTTTCTCTAGAGGAGTTGAAGGCTGCAGGCATCGCAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800724.1
MKHNNVIPNGHFKKHWQNYVKTWFNQPARKARRRNARQQKAIKIFPRPTAGPLRPVVRGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGIAKKLAPTIGIAVDHRRRNSSLEGFQTNVQRLKTFKAKLVVFPRRARKVKAGDSSPEELATATQVTGPFLPIVREKPNVELVKITQDMKSFKAYDKLRLERTNARHVGVRAKRAAEAEKEDKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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