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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002964`

染色体: Chr03 坐标: 46394273-46397932 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002964`
名称	SmilChr03G002964
描述	aluminum-activated malate transporter 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46394273 - 46397932 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016082`
GeneID	`131016082`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016082`
原始查询	`SmilChr03G002964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aluminum-activated malate transporter 4-like
产物	aluminum-activated malate transporter 4-like
Arabidopsis	`AT1G25480` (AT1G25480) aluminum activated malate transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839134] identity=60.4; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0730600` (OsSTA74) - identity=54.3; qcov=0.891; evalue=3.96e-175; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015743 (malate transport)
KEGG	-
Pfam	PF04632 (FUSC); PF11744 (ALMT); PF13515 (FUSC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016082

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800638.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057800638.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800638.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800638.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46394581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:46395529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C20,C25
`Chr3:46395553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46395679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46395873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:46395986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46396118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,B133,B90,B92
`Chr3:46396891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C47
`Chr3:46396924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C47,C8
`Chr3:46396957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C58,C6
`Chr3:46397008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C20
`Chr3:46397048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C8,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800638.1

579 aa

290

579

ALMT

FUSC_2

FUSC

PF11744 ALMT 70-547 aa PF13515 FUSC_2 106-228 aa PF04632 FUSC 109-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800638.1`	Pfam	`PF11744`	ALMT	Family	70	547	4.8e-182	606.8	Aluminium activated malate transporter
`XP_057800638.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	106	228	1.9e-11	44.9	Fusaric acid resistance protein-like
`XP_057800638.1`	Pfam	`PF04632`	FUSC	Family	109	258	1.1e-08	34.9	Fusaric acid resistance protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944655.1
ATTATTAAAAATAATTTCAATTAAAAAAAATAATAGACGAGTAAGAAACAATCGAACATGAGCAATCTTAATGCACATTCCAATCAACAACCTTAAAACAACTCAAGTTGTTGGACGGAAACAAATAAGATTTGATCATCATATGATTCTTGGTCCGAGAACCCACCATTGATGGCTGCAAATTACGGATCTTTGAGGCAGAGCTTCGTGGAACGAGGCAAGGAGAGATTGCTCTCAAGAAAACATAATTCAGAGGTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016082
ATGGCTGCAAATTACGGATCTTTGAGGCAGAGCTTCGTGGAACGAGGCAAGGAGAGATTGCTCTCAAGAAAACATAATTCAGAGGTGGGATTTAATGATCCATACATTGTCCGTGAGGGGTGTTTTCATTGGATTTTCCGAGTTGCGGGAGAGAGGATTTCGAGATTCTGGAATAATGTCAAGGGCACGACGGTTAAGTTGGTTGGAATGGGAAAATCCGACCCGAGAAAAGTGGTGTTTGCTGTCAAAATGGGCGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800638.1
MAANYGSLRQSFVERGKERLLSRKHNSEVGFNDPYIVREGCFHWIFRVAGERISRFWNNVKGTTVKLVGMGKSDPRKVVFAVKMGASLSLVSVLIFFKEPSNFISQNSIWAILTVVVVFEFSIGATLNKGFNRALGTFSAGALALGIAELSVKAGEFHEFIVLINIFLAGFLASYLKLYPAMKQYEYGFRVFLLTFCIVLVSGTSHFFQTAVSRLLLIAVGAGVCLVVNVCIYPIWAGEDLHKLVVKNFKGVASSIEGCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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