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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002965`

染色体: Chr03 坐标: 46398235-46400041 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002965`
名称	SmilChr03G002965
描述	uncharacterized SmilChr03G002965
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46398235 - 46400041 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016122`
GeneID	`131016122`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016122`
原始查询	`SmilChr03G002965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0600100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0600100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G38695` (AT2G38695) Gag-Pol polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745586] identity=31; qcov=0.533; evalue=1.55e-13; confidence=low
Rice	`Os04g0600100` - identity=73.4; qcov=0.604; evalue=9.53e-56; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016122

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800719.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057800719.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057800719.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800719.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46398536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46398542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A13,A7,A9,B100,B102,B111,B119,B12,B126,B127,B129,B13,B132,B135,B17,B18,B19,B34,B40,B44,B47,B57,B61,B67,B72,B73,B85,B86,B94,B97,C12,C14,C27,C29,C36,C46,C49,C55,D1,D2,D5
`Chr3:46398622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:46398624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:46398722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46398860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C87
`Chr3:46399644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B9
`Chr3:46399650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C77,D10
`Chr3:46399669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C77
`Chr3:46399719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,B133,B90,B92
`Chr3:46399751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:46399818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B9,C15,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944738.1
TCCACACCCAAATAACAGTGTCACAAGATTTCTTGAAGCTCAATTCTGAGTGATTTTAGATCAATCACAAATATTAAAATTCGAATTTTACTTTTATTGAATTTGAGTAAATTTTGATATGTAAAATAACTAAACCCAACTCCAACCACTTGTTTATCAAGACAGTGTGTGAAGGATGTGGGCTGCTGCTTCTCTCTCTGCACCTTCTTGTGCTGCACTACACACAATATTCCACAAACCCATCAAAACTAAATATTTTC...

XM_057944736.1
ACCCAAATAACAGTGTCACAAGATTTCTTGAAGCTCAATTCTGAGTGATTTTAGATCAATCACAAATATTAAAATTCGAATTTTACTTTTATTGAATTTGAGTAAATTTTGATATGTAAAATAACTAAACCCAACTCCAACCACTTGTTTATCAAGACAGTGTGTGAAGGATGTGGGCTGCTGCTTCTCTCTCTGCACCTTCTTGTGCTGCACTACACACAATATTCCACAAACCCATCAAAACTAAATATTTTCACAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016122
ATGTGGGCTGCTGCTTCTCTCTCTGCACCTTCTTGTGCTGCACTACACACAATATTCCACAAACCCATCAAAACTAAATATTTTCACAATAAAGACTCGATTTTTACTCATAAATTGCTTCGAAATCCAAGGCAAATCAACGAGCCCGCCACCGTTTCAGTCAGCTTTTGTGCTACTTCTGAAGATTCTTTCCTCCATCCAAATCAAGATTTCAGTAATAATCAGGAAAACAAAGGATTCTGGCAGAAATGGAAGGAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800719.1
MWAAASLSAPSCAALHTIFHKPIKTKYFHNKDSIFTHKLLRNPRQINEPATVSVSFCATSEDSFLHPNQDFSNNQENKGFWQKWKENSAKMSRKVAKLGLAAVLAYGIFDGVTYTSFFVAAFLGYEKSTGNNPAANLQALLGIVILMWGGNNVTRPFRVAGAAAMAPLIDTGLRRIQKYFNFPSVTYAFGLVAGIVVGLCATAVGLLVLSRWGK

XP_057800721.1
MWAAASLSAPSCAALHTIFHKPIKTKYFHNKDSIFTHKLLRNPRQINEPATVSVSFCATSEDSFLHPNQDFSNENKGFWQKWKENSAKMSRKVAKLGLAAVLAYGIFDGVTYTSFFVAAFLGYEKSTGNNPAANLQALLGIVILMWGGNNVTRPFRVAGAAAMAPLIDTGLRRIQKYFNFPSVTYAFGLVAGIVVGLCATAVGLLVLSRWGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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