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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002978`

染色体: Chr03 坐标: 46619819-46623735 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002978`
名称	SmilChr03G002978
描述	DNA-binding protein BIN4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46619819 - 46623735 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016097`
GeneID	`131016097`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016097`
原始查询	`SmilChr03G002978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-binding protein BIN4
产物	DNA-binding protein BIN4
Arabidopsis	`AT5G24630` (BIN4) double-stranded DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832534] identity=40.5; qcov=1.01; evalue=2.3e-63; confidence=medium
Rice	`Os02g0147700` (OJ1008_C03.26-2) - identity=44.6; qcov=0.737; evalue=4.52e-65; confidence=medium
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009330 (DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex); GO:0042023 (DNA endoreduplication); GO:0051276 (chromosome organization)
KEGG	-
Pfam	PF30948 (BIN4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016097

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800661.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057800661.1`
3	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057800661.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057800661.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057800661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46619975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C48
`Chr3:46620463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C37
`Chr3:46620566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C37
`Chr3:46621753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:46622373`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr3:46622373`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr3:46622690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C48
`Chr3:46622999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C48
`Chr3:46623203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:46623474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800661.1

414 aa

207

414

BIN4

PF30948 BIN4 236-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800661.1`	Pfam	`PF30948`	BIN4	Domain	236	324	1.3e-42	144.9	DNA-binding protein BIN4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944678.1
ACACCAGTCAAAATGGAGGGAAAGCCCCCAAATTTGTTTATTTTCTTTCCCTTTTTCCTCAGTGAGCTGCCACCGGAAGAAGGTGTCCATATATGCTGAATTAGGGTTTTGAAGTTTGCTTTTTCTTAATACATTACATACACTTTCAATGAGCGACTCCAGAGAAGAATCTCCCGATTGGTTGCGGGAATTTCAACCGCCAACTCGATCTGCCATAGAATTGTCATCTGGATCAGAGTCGCCATTGGATCAAAGTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016097
ATGAGCGACTCCAGAGAAGAATCTCCCGATTGGTTGCGGGAATTTCAACCGCCAACTCGATCTGCCATAGAATTGTCATCTGGATCAGAGTCGCCATTGGATCAAAGTCCAGTAAGTGATGATGAGGATAATGTCAACCTTAGTAGATTGTTTAAGAAAGATATTAAGAATAATGATGATGGAAAGGCGACTCTATCTGATAGTCCTGTCAAAGGGAAGTCTCCCAATAAGGGTGGTAAAGTAAAGAGGACTCCACCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800661.1
MSDSREESPDWLREFQPPTRSAIELSSGSESPLDQSPVSDDEDNVNLSRLFKKDIKNNDDGKATLSDSPVKGKSPNKGGKVKRTPPRKRKKDDDSERGNRAKGKDGCRGNTPENLGKSREENTSIWSLSSDSESSPDARPVKKSKTNKKELSASKDFDTEDKKENYGLLDHDVESLKNQAPKVKSPVKKLEKEGEKSSKEINTDSSIKGDNDTKDIFMKEDISGKRPGHQVSSSRVPLLLSEKVQRSKALVECEGDSIDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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