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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002982`

染色体: Chr03 坐标: 46635513-46636604 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002982`
名称	SmilChr03G002982
描述	F-box protein At5g07610-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46635513 - 46636604 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018885`
GeneID	`131018885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018885`
原始查询	`SmilChr03G002982`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g07610-like
产物	F-box protein At5g07610-like
Arabidopsis	`AT5G07610` (AT5G07610) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830654] identity=28.5; qcov=1.09; evalue=2.52e-29; confidence=low
Rice	`Os01g0876300` (OsFbox051) - identity=28.2; qcov=0.537; evalue=5.14e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803562.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803562.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803562.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803562.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46635551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:46635617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:46635721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:46635847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,B9
`Chr3:46635886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:46635897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46635908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:46635911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr3:46635968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,B133,B90,B92
`Chr3:46636023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr3:46636073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46636099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803562.1

363 aa

182

363

F-box

FBA_1

PF00646 F-box 9-43 aa PF07734 FBA_1 92-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803562.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	9	43	4.6e-07	30.2	F-box domain
`XP_057803562.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	92	207	1.9e-08	34.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947579.1
ATGACCGGAATATTCCCCTCGAACGAAGACATGGTGGTTGAAATCCTTCTCCGGCTGCCTGCAAAATCTCTAACCAGATTCAAATTAGTATGCAAACATTGGCTCTCTCTCATCTCTGCACAACAATTCTGCTATCTCCACACTCTCCGCCACCCAAAACCACAGCCCTCTCTCATCCTTCGAACTCATACCTCACACTATTTTTACTTCAATCCAGTTCCCAATAATCATAAGCTCATACCTTACAGTTTCACCATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018885
ATGACCGGAATATTCCCCTCGAACGAAGACATGGTGGTTGAAATCCTTCTCCGGCTGCCTGCAAAATCTCTAACCAGATTCAAATTAGTATGCAAACATTGGCTCTCTCTCATCTCTGCACAACAATTCTGCTATCTCCACACTCTCCGCCACCCAAAACCACAGCCCTCTCTCATCCTTCGAACTCATACCTCACACTATTTTTACTTCAATCCAGTTCCCAATAATCATAAGCTCATACCTTACAGTTTCACCATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803562.1
MTGIFPSNEDMVVEILLRLPAKSLTRFKLVCKHWLSLISAQQFCYLHTLRHPKPQPSLILRTHTSHYFYFNPVPNNHKLIPYSFTIPNSKILNSCNGLLLLQSVHPVEYHVYNSTTKQSRKISLADNSEDFTNVMGLTLAFDPSKSPHYKIVCVRAKMKPPSAHERHCRIEVYNSQSLTWRLCLEPLVAPIGANFSSGVHCNNVIHWDNYPRAHLYYNISKNVIGNLPHARVPWHGGGGGAASHCQLQESDGRLYHFIIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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