当前解析结果
SmilChr03G002992| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002992 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002992 |
| 描述 | UNC93-like protein 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 46732446 - 46735615 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016092 |
|---|---|
| GeneID | 131016092 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016092 |
| 原始查询 | SmilChr03G002992 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UNC93-like protein 1 |
| 产物 | UNC93-like protein 1 |
| Arabidopsis | AT1G18010 (AT1G18010)Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838381] identity=69.4; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os04g0105400- identity=65.7; qcov=0.674; evalue=3.03e-134; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05978 (UNC-93); PF07690 (MFS_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016092 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057800652.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057800652.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800652.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800652.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800652.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:46733970 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr3:46734235 |
GTT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B101 |
Chr3:46734235 |
GTT |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr3:46734245 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C13 |
Chr3:46734250 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A25,B77,C3,C71,C9 |
Chr3:46734761 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:46734803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B87,C70 |
Chr3:46734827 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr3:46734975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr3:46734978 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr3:46735019 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057800652.1PF07690
MFS_1 38-412 aa
PF05978
UNC-93 60-258 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057800652.1 |
Pfam | PF07690 |
MFS_1 | Family | 38 | 412 | 3.3e-12 | 46.7 | Major Facilitator Superfamily |
XP_057800652.1 |
Pfam | PF05978 |
UNC-93 | Family | 60 | 258 | 8.6e-18 | 65.4 | Ion channel regulatory protein UNC-93 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。