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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003000`

染色体: Chr03 坐标: 46819839-46820705 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003000`
名称	SmilChr03G003000
描述	uncharacterized SmilChr03G003000
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46819839 - 46820705 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018889`
GeneID	`131018889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018889`
原始查询	`SmilChr03G003000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=44; qcov=0.962; evalue=9.34e-74; confidence=medium
Rice	`Os07g0255200` - identity=35.6; qcov=0.76; evalue=6.83e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803565.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803565.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803565.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803565.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803565.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46819842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C49
`Chr3:46819846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B13,B96,C4,D8
`Chr3:46819851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr3:46819865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr3:46819885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B27,B75,C33,C55
`Chr3:46819885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B75,C33,C55
`Chr3:46819900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,D11
`Chr3:46819901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B104
`Chr3:46819906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B29,C87
`Chr3:46819961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B130,B58
`Chr3:46819977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B123,B55,C37
`Chr3:46819978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B130,B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803565.1

288 aa

144

288

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 125-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803565.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	125	171	2e-22	79.3	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947582.1
ATGGGTTCCAATGCTGAAGCTATGGAGTTGGAAAAGTTTTCTAAATGGATTGCGAGTATAGGCGATGGAACAATTGGAAGTGCAAATGATGGTCATGTCAACATTGATATTCCGACAGATTTGTTGATAAAATGGTCAGGAGATCCGATCGAACACATTGTTAATACCATTTACCCATCATATTGTGCTAATAATGTAGATATCAGTTATCTACAAGAAAGAGCAATACTCGCTCCAACTCTTAATGCTGTTGAATCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018889
ATGGGTTCCAATGCTGAAGCTATGGAGTTGGAAAAGTTTTCTAAATGGATTGCGAGTATAGGCGATGGAACAATTGGAAGTGCAAATGATGGTCATGTCAACATTGATATTCCGACAGATTTGTTGATAAAATGGTCAGGAGATCCGATCGAACACATTGTTAATACCATTTACCCATCATATTGTGCTAATAATGTAGATATCAGTTATCTACAAGAAAGAGCAATACTCGCTCCAACTCTTAATGCTGTTGAATCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803565.1
MGSNAEAMELEKFSKWIASIGDGTIGSANDGHVNIDIPTDLLIKWSGDPIEHIVNTIYPSYCANNVDISYLQERAILAPTLNAVESVNQYMISLNKTEGQLYRSSDSTSRSDSATDLVQQVHTPKFLNNIKCSGVPNHELYLKLGTPVMLLRNIDHANGLCNGTRLMITRLGHHVLEAQILTGDNAGQKILIPRMSLTPADPRLPFKLERRQFPLIVSYAMTINNSQGQSLSHVGLFLSKPVFTHGQLYVAVSRVRSREG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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