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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003005`

染色体: Chr03 坐标: 46888354-46891150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003005`
名称	SmilChr03G003005
描述	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 5
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46888354 - 46891150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016157`
GeneID	`131016157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016157`
原始查询	`SmilChr03G003005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 5
产物	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 5
Arabidopsis	`AT5G54140` (ILL3) IAA-leucine-resistant (ILR1)-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835501] identity=63; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0521800` (ILL5) - identity=62.1; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0009850 (auxin metabolic process); GO:0010179 (IAA-Ala conjugate hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01546 (Peptidase_M20); PF07687 (M20_dimer)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057800754.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.60000	`XP_057800754.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057800754.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800754.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46888733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B23
`Chr3:46888786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:46889214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr3:46889647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:46889683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B123,B55,C37
`Chr3:46889787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:46889846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C45
`Chr3:46890704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr3:46890779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C61
`Chr3:46890799`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B93
`Chr3:46890799`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B93
`Chr3:46890983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B123,B55,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800754.1

428 aa

214

428

Peptidase_M20

M20_dimer

PF01546 Peptidase_M20 104-419 aa PF07687 M20_dimer 217-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800754.1`	Pfam	`PF01546`	Peptidase_M20	Family	104	419	2e-41	142.9	Peptidase family M20/M25/M40
`XP_057800754.1`	Pfam	`PF07687`	M20_dimer	Domain	217	309	7.9e-09	36.2	Peptidase dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944771.1
AAAATATGACGGATGTAAAGTAGAAAAGAACACACTATTTGTTCGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCTGCTCTTAGTCTATAGACGGATTCTTCTCCAATCAATCAATCATGCGGTGAAAAAAAACCGGATTCTTCTCCCTGCTCTTAGTCTTTAGACGAAGAAAATCATGTTTCGAAACTCCAAGTTTTCAACTTTTTTGCTACTCCTGCTCACTTACTTAGCTAATTATCGAACGGAATCAACAAATTTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016157
ATGTTTCGAAACTCCAAGTTTTCAACTTTTTTGCTACTCCTGCTCACTTACTTAGCTAATTATCGAACGGAATCAACAAATTTTGATCAAGAATATGCAAAGGAGATTCTTAGCTCAGCCCAGCAGGAAAAAGATTGGTTAGTCTCAATTAGAAGGAAAATTCACGAAAACCCAGAGCTCGCATTTCAAGAATTCAACACTAGTGCCTTAATTCGCAGCAAACTCGATGAACTCGGAATTTTTTATGAGTACCCATTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800754.1
MFRNSKFSTFLLLLLTYLANYRTESTNFDQEYAKEILSSAQQEKDWLVSIRRKIHENPELAFQEFNTSALIRSKLDELGIFYEYPFAKTGLVAQIGSGSRPVVALRADMDALPLQELVEWDHKSKLDGLMHGCGHDAHTTMLLGAAKLLHRRKHKLKGTVRLLFQPGEEGGAGASHMIKEGALGGAEAIFGMHVDFTNPTGSISSVPGPILAAVSFFEAKIVGKGGHGAAPHHSIDPVVAASYTILALQQLISREVDPLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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