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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003014`

染色体: Chr03 坐标: 47029132-47030911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003014`
名称	SmilChr03G003014
描述	RPM1 interacting protein 13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47029132 - 47030911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016165`
GeneID	`131016165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016165`
原始查询	`SmilChr03G003014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPM1 interacting protein 13-like
产物	RPM1 interacting protein 13-like
Arabidopsis	`AT4G27660` (AT4G27660) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828880] identity=50; qcov=0.79; evalue=1.09e-43; confidence=medium
Rice	`Os10g0573300` - identity=48.3; qcov=0.695; evalue=2.55e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27679 (RIN13_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800774.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800774.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800774.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800774.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47029457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A10,A2,A24,B102,B131,B14,B28,C42,C55,C64,C83
`Chr3:47029460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B44,B92
`Chr3:47029463`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B11,B44,B92
`Chr3:47029463`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B11,B44,B92
`Chr3:47029465`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B11,B44,B92
`Chr3:47029465`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B11,B44,B92
`Chr3:47029487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B44,B92
`Chr3:47030523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C38,C61
`Chr3:47030540`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A2,A24,B102,B105,B111,B112,B123,B125,B135,B15,B25,B28,B44,B55,B72,B89,B90,B92,B95,C33,C42,C55,C62,C64,C67,C75,C83,D1,D3
`Chr3:47030696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A24
`Chr3:47030696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800774.1

167 aa

167

RIN13_N

PF27679 RIN13_N 96-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800774.1`	Pfam	`PF27679`	RIN13_N	Domain	96	158	3.2e-24	85.6	RPM1 interacting protein 13 N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944791.1
AAAGCCCGGCCCATATAAGCTGCAATCCATAACCTTTTCCCACCGTCGCTCATATTCACGAATTTGAAATTCTCCAAGATTCAGTTTTTACTCTGATACAACCGAAAAGAAGAATACATTAAAAAAGAAGCAACCTTTGAAATTTCCAGGAACAATTTCCCAAAAATTTAATCCCTCAAATGGGCAGTAAATACGCTGTGAAGAAACGGAGAGTTCAGAGGGATCCGAAGATGGCCGTAAAACAGGAAGTGATCGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016165
ATGGGCAGTAAATACGCTGTGAAGAAACGGAGAGTTCAGAGGGATCCGAAGATGGCCGTAAAACAGGAAGTGATCGAAATCGACGATTCGTGCCCTTCTCCCGTTCAAAACGGCACTCCTCTAAGACCTATGTTTTGTCTGAAAAATAGAGAAGAAATCAAGAAATTCGAGCAGGAAGAAGAGTGCTTCATTCTTGAATTCGATCCCTACCATAACTTGGATGTGGCGAAGTTGCCTAGCAATGCTGAGGCCGAGTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800774.1
MGSKYAVKKRRVQRDPKMAVKQEVIEIDDSCPSPVQNGTPLRPMFCLKNREEIKKFEQEEECFILEFDPYHNLDVAKLPSNAEAEFSIVAETGQVACRDYPHPRNTCAKFPFNQTPHDKHCKMCYCYVCDLSAPCLKWTGSSGHCHAFKNEAWDDEKRVRRQVTKTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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