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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003020`

染色体: Chr03 坐标: 47109364-47111929 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003020`
名称	SmilChr03G003020
描述	uncharacterized SmilChr03G003020
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47109364 - 47111929 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018895`
GeneID	`131018895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018895`
原始查询	`SmilChr03G003020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0152500` - identity=23.4; qcov=0.443; evalue=4.18e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803571.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057803571.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803571.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803571.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803571.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47109369`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr3:47109369`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr3:47109497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:47109514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:47109521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B29,B4,C8,D3
`Chr3:47109522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C18
`Chr3:47110267`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,B68
`Chr3:47110267`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B1,B68
`Chr3:47110493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:47110502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:47110617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:47110630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803571.1

530 aa

265

530

DUF8566

PF29561 DUF8566 117-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803571.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	117	318	2.3e-51	175.2	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947588.1
ATGACTGGGAAGGGGAAGAAGGTAGTACGTTCAGGGACAATGACTGGGAAGGGGAAAAAGGTAGTACGGTCAGATGATAGCGAGCCATCATCACCACCAGTTTCTGCAAGTAAGAGGAGGAAAGTATATGAAGCAGGTGGGAGCTCATCCACGGTTGATGCCAATCTTAAGGCGAAAAAGGAGGCTTTCAAAAAAGCAAAAAGGATAATAACCACAGAGGAACAAGCCGAGGGGGTTAAGCTAAAAAGAAGGAGGAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018895
ATGACTGGGAAGGGGAAGAAGGTAGTACGTTCAGGGACAATGACTGGGAAGGGGAAAAAGGTAGTACGGTCAGATGATAGCGAGCCATCATCACCACCAGTTTCTGCAAGTAAGAGGAGGAAAGTATATGAAGCAGGTGGGAGCTCATCCACGGTTGATGCCAATCTTAAGGCGAAAAAGGAGGCTTTCAAAAAAGCAAAAAGGATAATAACCACAGAGGAACAAGCCGAGGGGGTTAAGCTAAAAAGAAGGAGGAGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803571.1
MTGKGKKVVRSGTMTGKGKKVVRSDDSEPSSPPVSASKRRKVYEAGGSSSTVDANLKAKKEAFKKAKRIITTEEQAEGVKLKRRRRFNQQKDATCKRRGALKINQEEEPVKFPSLYTRTTPSSFYDALQQLNDDQKKAVHDIGFGSILSLQVKKLPCRLAYWILEKFDERRCELELDGGSRVKITEDDVYRVYGFPKGTETIPIFSRATNNALCEQWAAFFGFASCEKIKIGLVLREMLDCTTGGTWFKHHFMIAMAHTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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