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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003023`

染色体: Chr03 坐标: 47138749-47141655 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003023`
名称	SmilChr03G003023
描述	uncharacterized SmilChr03G003023
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47138749 - 47141655 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018900`
GeneID	`131018900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018900`
原始查询	`SmilChr03G003023`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine-type peptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815294]; symbol=AT2G07240; hit=AT2G07240; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cysteine-type peptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815294]; symbol=AT2G07240; hit=AT2G07240; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G07240` (AT2G07240) cysteine-type peptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815294] identity=25.9; qcov=0.328; evalue=8.8e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803573.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057803573.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803573.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803573.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803573.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47138756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:47138809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C22,C64,C66
`Chr3:47138830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C42
`Chr3:47138831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:47138842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:47138848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:47138849`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B102
`Chr3:47138849`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B102
`Chr3:47138876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C19,C41
`Chr3:47138916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A8,B123,B66,B79,C49,C53,C54,C60,D11
`Chr3:47138954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,C45,C57,C62,C75
`Chr3:47138972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803573.1

577 aa

288

577

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 357-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803573.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	357	548	1.5e-17	64.9	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947590.1
CTATGTACGGAACGCTATATTTGAAGAGATACAAACCACATTGAAGGCTGTTGGTGGCAAATCTACTATACAAACATTCAAAGGTGGAACAATTGGGCGTCTTAGTGATCACGAGAGATACGCTAGCGCCAACAATGTTCTGCATCACCTATTATCTCGACAGATTGAGGGAGGGGATATACCTCCTCATGAAGCATGGTTTGTTGTCGGTAGTCGTATCATTCGTTTTACAACACCGGATTACGCACTAATTACCAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018900
ATGTGGACAACCAGAAAAGCTCCTGGCGATTTCACATATTTTTTCGACAAAGAGCTTATTGTGCACGAGACGCTTCAGCCATCCCCTGAAGAGCTAGAGGAGGTGTACTACATGAGCCTAGACAATGAAGATATGCTCCATGTTAGATTCGTGCCTCCTCTACGTCTTGCATCGAAGAAGAAGACAACTCATGTTCCAAAGCGGCGTAGAATGAGATCTCCAACACTTGAGAGGGATAGTAGGCAGGTTTCGCCGGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803573.1
MWTTRKAPGDFTYFFDKELIVHETLQPSPEELEEVYYMSLDNEDMLHVRFVPPLRLASKKKTTHVPKRRRMRSPTLERDSRQVSPAVQREGPRSSPLREERHSSPVVEMRERHSSPRVETRDSPVIDSTLTCCHHGVPCRDSGKDCHDYIDQRLTRMLHDESDDGFIARVARRVLSGMKEMLDCTGDKSIRLSPRRSVGHVSPVRSTSHVHHWHHSTSRVEQPLPHRSTSPVEHPHGSPSPVEQLHQSLSHVLTTPVQPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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