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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003025`

染色体: Chr03 坐标: 47149906-47151958 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003025`
名称	SmilChr03G003025
描述	probable glucuronoxylan glucuronosyltransferase IRX7
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47149906 - 47151958 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016171`
GeneID	`131016171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016171`
原始查询	`SmilChr03G003025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glucuronoxylan glucuronosyltransferase IRX7
产物	probable glucuronoxylan glucuronosyltransferase IRX7
Arabidopsis	`AT2G28110` (FRA8) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817357] identity=66; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0107900` - identity=56.4; qcov=0.938; evalue=3.54e-169; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057800780.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057800780.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800780.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800780.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800780.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47150052`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A5,B112,C1,C4,C43,C65
`Chr3:47150124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B26,B98,C27,C80
`Chr3:47150130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B130,B51,B52
`Chr3:47150181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A10,B103,B129,B132,B40,B42,B63,B68,B78,B8,B80,B81,B83,B86,B90,C13,C19,C21,C25,C26,C30,C38,C54,C73,C74,C80,C9
`Chr3:47150211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:47150231`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C24,C63
`Chr3:47150231`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C24,C63
`Chr3:47150232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr3:47150271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B94,D5
`Chr3:47150294`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B103,C11,C9
`Chr3:47150294`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B103,C11,C9
`Chr3:47150300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C11,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800780.1

451 aa

226

451

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 96-393 aa

XP_057800781.1

450 aa

225

450

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 95-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800780.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	96	393	2.5e-75	254.3	Exostosin GT47 domain
`XP_057800781.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	95	392	2.5e-75	254.3	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944797.1
CCCTGCTCCCATCATTCGTTCCCTGTTTTCTTAATTCCCACTTCAACTCAATACCAAATACAGAAAGCCCCATTCAACCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTCTCTCTAGAGAGGTTTAAGAGAGGGAGAAACAGATGAGCTTGCAGCTGGAAACCAATCGACCCACCCAGAAGAAAGCCTTGTTCTATGCTAGGATGAAGCTTCTGCACAGCAGAAACAATAATCTATCTAAAAATTTATGTTACAAATTCTT...

XM_057944798.1
CTCCCATCATTCGTTCCCTGTTTTCTTAATTCCCACTTCAACTCAATACCAAATACAGAAAGCCCCATTCAACCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTCTCTCTAGAGAGGTTTAAGAGAGGGAGAAACAGATGAGCTTGCAGCTGGAAACCAATCGACCCACCCAGAAGAAAGCCTTGTTCTATGCTAGGATGAAGCTTCTGCACAGCAGAAACAATAATCTATCTAAAAATTTATGTTACAAATTCTTCAAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016171
ATGAGCTTGCAGCTGGAAACCAATCGACCCACCCAGAAGAAAGCCTTGTTCTATGCTAGGATGAAGCTTCTGCACAGCAGAAACAATAATCTATCTAAAAATTTATGTTACAAATTCTTCAAATATGTCATCTGGTTTTCAATCTCGCTCTATTTCCTCTCCTCCTTGATCATCACCCGCCACAACCCCACCATATCCAGAACCACCATCTCCCGCTCTAAGCCCTCCCGAGCTCTCATGGAGGAAGACCCCCGCCTCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800780.1
MSLQLETNRPTQKKALFYARMKLLHSRNNNLSKNLCYKFFKYVIWFSISLYFLSSLIITRHNPTISRTTISRSKPSRALMEEDPRLDSSAHAGLFNGMKIYVYDLPAKFNGEWLANERCSRHLFAAEVAIHRALMNSEVRTFDPWQADFFFVPVYVSCNFSQVNGFPAIGHARSLMASAIQHVSSQLPFWNRSLGADHVFVASHDFGSCFHTMEDMAIAEGVPEFLRNSIILQTFGVEHKHPCQEVENVVVPPYVSPESV...

XP_057800781.1
MSLQLETNRPTQKKALFYARMKLLHSRNNNLSKNLCYKFFKYVIWFSISLYFLSSLIITRHNPTISRTTISRSKPSRALMEEDPRLDSSAHGLFNGMKIYVYDLPAKFNGEWLANERCSRHLFAAEVAIHRALMNSEVRTFDPWQADFFFVPVYVSCNFSQVNGFPAIGHARSLMASAIQHVSSQLPFWNRSLGADHVFVASHDFGSCFHTMEDMAIAEGVPEFLRNSIILQTFGVEHKHPCQEVENVVVPPYVSPESVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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