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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003041`

染色体: Chr03 坐标: 47311345-47321670 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003041`
名称	SmilChr03G003041
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47311345 - 47321670 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016186`
GeneID	`131016186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016186`
原始查询	`SmilChr03G003041`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A-like
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A-like
Arabidopsis	`AT3G23590` (RFR1) REF4-related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821938] identity=57.1; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0681500` (OsMED5_3) - identity=40.1; qcov=1; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0016592 (mediator complex); GO:2000762 (regulation of phenylpropanoid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF27769 (MED33_C); PF27774 (MED33_TPR-like_mid); PF27814 (MED33_TPR-like_2nd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800798.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800798.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800798.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800798.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47312248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:47312284`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B87,C73
`Chr3:47312284`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B87,C73
`Chr3:47314262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D11
`Chr3:47314714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C39,C51,C58,C61
`Chr3:47314842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:47314864`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A14
`Chr3:47314864`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A14
`Chr3:47314940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:47317878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C45
`Chr3:47318327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:47319074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800798.1

1333 aa

666

1333

MED33_TPR-like_2nd

MED33_TPR-like_mid

MED33_C

PF27814 MED33_TPR-like_2nd 110-295 aa PF27774 MED33_TPR-like_mid 805-1038 aa PF27769 MED33_C 1105-1289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800798.1`	Pfam	`PF27814`	MED33_TPR-like_2nd	Repeat	110	295	1.2e-80	270.4	Mediator subunit 33 second TPR-like domain
`XP_057800798.1`	Pfam	`PF27774`	MED33_TPR-like_mid	Repeat	805	1038	4.2e-123	409.9	Mediator subunit 33 middle TPR-like domain
`XP_057800798.1`	Pfam	`PF27769`	MED33_C	Repeat	1105	1289	4.4e-83	278.2	Mediator subunit 33 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944815.1
CTACTCTAATAAACCTTCCTTCTTCTGGGTTTTTTTATCCTGTTCAAATTTGCACTCACACAGTGAAGGTGTAGCCGGAGTTATTCCGTCGTCTCCAAATTCCACGCCCTAAATTCCTGCACTTCTGGTGCTTGAATTTGGCAATTAGAGATCATATGGCGGCGGCGGCGGGTGAGGAGGAGGAGTCGGCCAAGCAGAGGCTCTGGGACGGCGTGCTGGAGCTGACCAAGGCCGCGCAGGAGAGGGGCACCGATCCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016186
ATGGCGGCGGCGGCGGGTGAGGAGGAGGAGTCGGCCAAGCAGAGGCTCTGGGACGGCGTGCTGGAGCTGACCAAGGCCGCGCAGGAGAGGGGCACCGATCCCCTCATGTGGGCCATGCAGCTTTCCGGAAGCCTCACCGCTGCCGGAGTTTCCATGCCCTCCGTTGAGCTGGCGGAGGTTCTCGTTTCTCATATTTGCTGGTCGAATAACCACCCAATCGCCTGGAAATTCCTCGAGAAGGCGCTTACTATTCGCATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800798.1
MAAAAGEEEESAKQRLWDGVLELTKAAQERGTDPLMWAMQLSGSLTAAGVSMPSVELAEVLVSHICWSNNHPIAWKFLEKALTIRIVPPMLILALLSTRVIPSRRRYPVAYRLYMELLKRYAFSLLSLINGPNYQKIMESINDVLQFYQIFGVQSSEPGILIVIFVFSIVWELLDASLDDEGLLELTAEKKSRWPVRSQDMDIDYLDNFDGKRMERQEALSKINTIMAVEMLGAFFCDKTTSRILYLARRNMPVHWECFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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