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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003044`

染色体: Chr03 坐标: 47340689-47342276 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003044`
名称	SmilChr03G003044
描述	EID1-like F-box protein 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47340689 - 47342276 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016189`
GeneID	`131016189`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016189`
原始查询	`SmilChr03G003044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	EID1-like F-box protein 3
产物	EID1-like F-box protein 3
Arabidopsis	`AT3G63060` (EDL3) EID1-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825481] identity=61.6; qcov=0.729; evalue=1.83e-102; confidence=high
Rice	`Os01g0802600` - identity=52.5; qcov=0.798; evalue=9.76e-88; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF27778 (EID2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016189

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800802.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800802.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800802.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800802.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47340911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B123,B55,C37
`Chr3:47341172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C47
`Chr3:47341183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:47341517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B76,C47
`Chr3:47341589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B58,B66,B87,C31
`Chr3:47341701`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A15,A23,A9,B100,B103,B107,B109,B11,B119,B125,B127,B128,B13,B137,B18,B22,B41,B5,B51,B54,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B66,B70,B71,B72,B73,B75,B82,B85,B87,B88,B89,B98,C10,C12,C21,C23,C29,C31,C34,C40,C47,C49,C52,C57,C60,C62,C63,C67,C70,C71,C79,C80,C81,C82,C87,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800802.1

332 aa

166

332

EID2_C

PF27778 EID2_C 145-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800802.1`	Pfam	`PF27778`	EID2_C	Domain	145	283	8.1e-53	178.4	EID1-like F-box protein 2 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944819.1
ATCATAGCCACTTAAACTTAAATAAACATTATAGTCTATGTCGCTTACACCTGGATTATTAGAAGCATAATGATTATGAAAAAGAAGAACTTTTGAGTATGAATTCTCTACGAACATCCGACAACACATCAAAGGATTTAATCCAAACCCAAAAATCGAGTCAGCAAATAGTCAAAACTGTTGTTACGTGGTGTACAACCACTACTCCCACGCGTACACCCGTCATTAGCTGCCCACCACCATCAAGATTCAAAGATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016189
ATGGAAACGCAGCACGTGCTCGATCGCCCGCATTTAGTTTTCCACGTGTCCCAGCCCGTTATAAAATCCGTTTTCCCCGGCGTAGAGAGTTGTTGTTGCCGGGGAGAGAGAGAGAGAGGAATGGGGGAGTGGGGGAGTGCGAGTCAGGTGCTGAGACTCAGTGAGTCGGCCAACTCGGGCCTGCTCAACGAGCGAGTTCTGTTTCTAGTGTTCGAGTACATGAAGTGGGACATCCGCACGCTCTGCCGCGTGGCAGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800802.1
METQHVLDRPHLVFHVSQPVIKSVFPGVESCCCRGERERGMGEWGSASQVLRLSESANSGLLNERVLFLVFEYMKWDIRTLCRVAAVSWKLRALAKRLLWRELCIYRAPRMIATLTEGATNSRIIGGWPALAKLLFFCGGCESTRHFRLSRPSPGHFAEESRFSKTSGRSFLSKSCRGDVLYVSDPCEHAAGGGGEDAERHDDVGVYRGVFRAFFKSRTRECLIRKRIEFEEGMRCPYCAARVWSMTAARLIPQKTAARK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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