当前解析结果
SmilChr03G003047| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003047 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003047 |
| 描述 | ENHANCER OF AG-4 protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 47374089 - 47375239 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016193 |
|---|---|
| GeneID | 131016193 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016193 |
| 原始查询 | SmilChr03G003047 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ENHANCER OF AG-4 protein 2-like |
| 产物 | ENHANCER OF AG-4 protein 2-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016193 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057800807.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800808.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057800808.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057800808.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800807.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:47374115 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B123,B128,B135,B98,D4 |
Chr3:47374115 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B123,B128,B135,B98,D4 |
Chr3:47374370 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B75,C31 |
Chr3:47374596 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C63,C64,C70 |
Chr3:47375052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B97 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。