当前解析结果
SmilChr03G003049| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003049 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003049 |
| 描述 | small polypeptide DEVIL 14 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 47392602 - 47393188 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016197 |
|---|---|
| GeneID | 131016197 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016197 |
| 原始查询 | SmilChr03G003049 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | small polypeptide DEVIL 14 |
| 产物 | small polypeptide DEVIL 14 |
| Arabidopsis | AT3G63088 (RTFL14)ROTUNDIFOLIA like 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719424] identity=58.8; qcov=0.739; evalue=1.48e-08; confidence=low |
| Rice | Os01g0525350- identity=76.9; qcov=0.565; evalue=5.43e-09; confidence=low |
| GO | GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08137 (DVL) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016197 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057800814.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057800814.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800814.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800814.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800814.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:47392873 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C14 |
Chr3:47392873 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C14 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057800814.1PF08137
DVL 25-43 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057800814.1 |
Pfam | PF08137 |
DVL | Family | 25 | 43 | 7.4e-10 | 39.2 | DVL family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。