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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003050`

染色体: Chr03 坐标: 47393487-47398023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003050`
名称	SmilChr03G003050
描述	uncharacterized SmilChr03G003050
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47393487 - 47398023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016195`
GeneID	`131016195`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016195`
原始查询	`SmilChr03G003050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ELKS/Rab6-interacting/CAST family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828150]; symbol=AT4G02880; hit=AT4G02880; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	ELKS/Rab6-interacting/CAST family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828150]; symbol=AT4G02880; hit=AT4G02880; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G02880` (AT4G02880) ELKS/Rab6-interacting/CAST family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828150] identity=41.1; qcov=1.01; evalue=2.36e-104; confidence=medium
Rice	`Os10g0315400` (SIP28) - identity=53.1; qcov=0.329; evalue=3.34e-53; confidence=low
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF31072 (CUE_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016195

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800811.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800811.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800811.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800811.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800811.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47393766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47394357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B2,B63,B83,C59
`Chr3:47394847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:47394886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:47396047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47396194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:47396217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B2,B83,C59
`Chr3:47396294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B48
`Chr3:47396418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47396570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B46,C76
`Chr3:47396581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B46,C76
`Chr3:47396615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800811.1

596 aa

298

596

CUE_1

PF31072 CUE_1 1-45 aa

XP_057800812.1

596 aa

298

596

CUE_1

PF31072 CUE_1 1-45 aa

XP_057800813.1

596 aa

298

596

CUE_1

PF31072 CUE_1 1-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800811.1`	Pfam	`PF31072`	CUE_1	Domain	1	45	7.2e-22	78.1	CUE domain
`XP_057800812.1`	Pfam	`PF31072`	CUE_1	Domain	1	45	7.2e-22	78.1	CUE domain
`XP_057800813.1`	Pfam	`PF31072`	CUE_1	Domain	1	45	7.2e-22	78.1	CUE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944830.1
ATCTCGGAATTGCTTAGTGCCTAGGTTTCTTAGCGCCCAGGTTGTCTCTCTCCTCCCTCCGCTTAAAATAGTCGTACACGCGGGTAAACGAATTCACATGGGAGAAAATAGTCAAACTTAGATGAAAAGTACAACTCAACGAAGCACCTCGCCAGCTGCGCCACTATCACTACGTATAAATAGGACACGAATATGAGTTTCCAGAAAGTCTACGAGTCACTGCAAGATCTTTTTCCGCTGATTGATGATCGAGCTCTTAG...

XM_057944828.1
ATCTCGGAATTGCTTAGTGCCTAGGTTTCTTAGCGCCCAGGTTGTCTCTCTCCTCCCTCCGCTTAAAATAGTCGTACACGCGGGTAAACGAATTCACATGGGAGAAAATAGTCAAACTTAGATGAAAAGTACAACTCAACGAAGCACCTCGCCAGCTGCGCCACTATCACTACGTATAAATAGGTAGATTTTGTTCGATCGTTTTATCTTCCCGCATGTATGTATAATCTAGCTGACATTTTGCGCACGTAATTGCTGAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016195
ATGAGTTTCCAGAAAGTCTACGAGTCACTGCAAGATCTTTTTCCGCTGATTGATGATCGAGCTCTTAGAGCTGTTGCTATCGAGCACAGCAAGGATGTAGATGCGGCTGTTGTAGCAGTTCTTGAAGAGATAATTCCTTTCTTCACTGTAAGATCTACACCAAATAGTCCTTTGGGTCGGAGTGTTTGTGAAGGTGAATCGTCGAAAGGTAGCTCGTCTGTGAGAACAGAGGTTGTACCTCAAGAAGAGAATGATCATAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800811.1
MSFQKVYESLQDLFPLIDDRALRAVAIEHSKDVDAAVVAVLEEIIPFFTVRSTPNSPLGRSVCEGESSKGSSSVRTEVVPQEENDHRFVSGNSQPSTSADDGLSEPFRDAIAGHSESEDDTAQLTLSVETHDDGIKMNADIHSQSESLVVIGEDRVGTCQIEVSGGPQTESTVSADKYLENSSETSCGSSSQITVGMSQDVEMDVVQKMDCIPENENDADGTAHDLSASSSWVEAPDMLGSNLDKSNLSFSTDITSSGKN...

XP_057800812.1
MSFQKVYESLQDLFPLIDDRALRAVAIEHSKDVDAAVVAVLEEIIPFFTVRSTPNSPLGRSVCEGESSKGSSSVRTEVVPQEENDHRFVSGNSQPSTSADDGLSEPFRDAIAGHSESEDDTAQLTLSVETHDDGIKMNADIHSQSESLVVIGEDRVGTCQIEVSGGPQTESTVSADKYLENSSETSCGSSSQITVGMSQDVEMDVVQKMDCIPENENDADGTAHDLSASSSWVEAPDMLGSNLDKSNLSFSTDITSSGKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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