当前解析结果
SmilChr03G003059| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003059 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003059 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003059 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 47479371 - 47480563 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018906 |
|---|---|
| GeneID | 131018906 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018906 |
| 原始查询 | SmilChr03G003059 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018906 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803579.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057803579.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057803579.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057803579.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803579.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:47479412 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A6,B68,B82,C40 |
Chr3:47479417 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr3:47479568 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B27 |
Chr3:47479571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr3:47479606 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B76 |
Chr3:47479609 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B88 |
Chr3:47479619 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B119 |
Chr3:47479675 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | A13,A20,A22,B117,B123,B128,B14,B58,B62,B64,B80,B91,C39,C43,C5,C58,C84,D2 |
Chr3:47479745 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,B59,B76 |
Chr3:47479766 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B22,C25 |
Chr3:47479789 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,C4 |
Chr3:47479802 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B119 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。