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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003060`

染色体: Chr03 坐标: 47539598-47543187 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003060`
名称	SmilChr03G003060
描述	uncharacterized SmilChr03G003060
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47539598 - 47543187 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016209`
GeneID	`131016209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016209`
原始查询	`SmilChr03G003060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	R3H domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838557]; symbol=AT1G03250; hit=AT1G03250; species=arabidopsis; confidence=high
产物	R3H domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838557]; symbol=AT1G03250; hit=AT1G03250; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G03250` (AT1G03250) R3H domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838557] identity=59.4; qcov=1; evalue=3.13e-105; confidence=high
Rice	`Os12g0144000` - identity=57.2; qcov=0.952; evalue=6.26e-92; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF13902 (R3H-assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800831.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800832.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800831.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800832.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47539926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C39,C51,C58,C60
`Chr3:47540689`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr3:47540689`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr3:47542042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B12,B134,B48,D6
`Chr3:47542068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:47542407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47542815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B55,B94,D10,D11
`Chr3:47542833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:47542889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C45
`Chr3:47542892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800831.1

251 aa

126

251

R3H-assoc

PF13902 R3H-assoc 33-152 aa

XP_057800832.1

248 aa

124

248

R3H-assoc

PF13902 R3H-assoc 33-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800831.1`	Pfam	`PF13902`	R3H-assoc	Domain	33	152	3.5e-34	118.6	R3H-associated N-terminal domain
`XP_057800832.1`	Pfam	`PF13902`	R3H-assoc	Domain	33	152	3.2e-34	118.8	R3H-associated N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944849.1
TGCTCCACACTTCACCAATTTCTGGATAATTGACTCTCCAAAAAAAAATTCTGGATAATTGACGCCATAAAATATAATTATAAAGGATTAAAACTTAAAAGTCAAAAAAAGAAAATAGCCCTATGTTTTAGCATATAAGATGCATAGAAAGCATATTCCCAGTTATCTATCCACTGCGTCCACGCTTAAGACCGTGTTTGGCATACGCCTTCAAAACTTCAACTTCCAAACATTCAGATAAATTTCAGCTGCATACAATC...

XM_057944848.1
AAATAGCCCTATGTTTTAGCATATAAGATGCATAGAAAGCATATTCCCAGTTATCTATCCACTGCGTCCACGCTTAAGACCGTGTTTGGCATACGCCTTCAAAACTTCAACTTCCAAACATTCAGATAAATTTCAGCTGCATACAATCTCTCTTCCAACAACTCAAATCGTCAAAAATTTAACATTCCCTCTAGCAAAAGATCGAAAAGAATCATGGCGACCCCACAAATTTTGCAGACGGAGCAGGATCTTCTTATGTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016209
ATGGCGACCCCACAAATTTTGCAGACGGAGCAGGATCTTCTTATGTATGCGTCCCTCTTTCCCAAAGATGAAAATGTGAGACCTCGAGGCGTGGAAATCGAGAAGAAGATTGAGTATCTCGAGAACTTGGCCGGAAATGTTAGGAACAGGAGATCTCGCAGATGGTTAAATGATCGCTTGTTGATGGAGCTCGTTCCTCGGTTGAATGCTGAGGAGATTAGAGGATTGTTTGCTCCACCGCCATGGGGTGAGGATGTGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800831.1
MATPQILQTEQDLLMYASLFPKDENVRPRGVEIEKKIEYLENLAGNVRNRRSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGEDVPRSAFCMTNVGEWDNFRNIDMDKEASIMESLENSSSKRRDRQDADKVAVLTAWHRVDGRTREALRRCYLTDLVSGYEECVRSFVKDSGNKDVLVLRVQDPFHRLLLHGVCEVFSSILFILSRLDSPLWRFPMDHQACIFVHEHDVLTNYFFSDKREFCVRPSNMS

XP_057800832.1
MATPQILQTEQDLLMYASLFPKDENVRPRGVEIEKKIEYLENLAGNVRNRRSRRWLNDRLLMELVPRLNAEEIRGLFAPPPWGEDVPRSAFCMTNVGEWDNFRNIDMDKEASIMESLENSSSKRRDRQDADKVAVLTAWHRVDGRTREALRRCYLTDLVSGYEECVRSFVKDSGNKDVLVLRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLISTTVAQSKGGSAPVKTTRIKKKQSPSSELPKITLCNFLKMAKEGFW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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