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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003061`

染色体: Chr03 坐标: 47558072-47559707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003061`
名称	SmilChr03G003061
描述	uncharacterized SmilChr03G003061
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47558072 - 47559707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016207`
GeneID	`131016207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016207`
原始查询	`SmilChr03G003061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838493]; symbol=AT1G03210; hit=AT1G03210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838493]; symbol=AT1G03210; hit=AT1G03210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G03210` (AT1G03210) Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838493] identity=46.9; qcov=1.02; evalue=3.13e-80; confidence=high
Rice	`Os03g0434400` - identity=39.9; qcov=1.08; evalue=9.14e-70; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0016853 (isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02567 (PhzC-PhzF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800830.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800830.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057800830.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800830.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47558485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:47558890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:47559103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B129,B50,C33
`Chr3:47559152`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A16,A4,A7,B10,B105,B106,B110,B113,B118,B124,B130,B136,B138,B16,B26,B30,B36,B37,B44,B60,B80,B81,B90,B91,B92,C11,C16,C17,C24,C28,C29,C30,C35,C4,C40,C46,C5,C52,C6,C69,C7,C75,D3
`Chr3:47559353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:47559523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C45,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800830.1

281 aa

140

281

PhzC-PhzF

PF02567 PhzC-PhzF 11-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800830.1`	Pfam	`PF02567`	PhzC-PhzF	Family	11	277	3.6e-60	204.6	Phenazine biosynthesis-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944847.1
AAAGCAGTCGCAGGATAGAACAACCTTATAGTGAGAGTTGAGGTGGGTTGCAGTAAAACTTTGCTGCCAAATCTCTTCAAATCTAATGTTGCAACTGTTGCAATAGATGCAACACTTCATCTGCACAACTAAGGTAAAAAAATGTTGGCTTCGTGGGGCCATTCCACATGAAGTGGAAATAGCTCAACACAATTTGTGGGGATGAATTTAAACACACATACATCTGCATTTCTGTTGGAGAATAATGGCGAAAAAGCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016207
ATGGCGAAAAAGCTAGTGAAGTACTGTTTGGTGGATACGTTTGCAGAGACGGCGTTCAAAGGGAATCCGTCGTCGGTATGCGTGGTGGAGGAGGAGAAAGATCCCGAGTGGCTGCGGAATGTGGCTCGCGAGTTCAACCAGGCTGTGACCAGCTACTTGACTCAGTCCACCACCGGCTTCCAGCTGCGGTGGTTCACTCGCGACGGCGATGAGATTTCAATTTGTGGGCATGCAACTCTAGCAGCAGCCTATTATATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800830.1
MAKKLVKYCLVDTFAETAFKGNPSSVCVVEEEKDPEWLRNVAREFNQAVTSYLTQSTTGFQLRWFTRDGDEISICGHATLAAAYYILLRLLPTGDAVQLSTLSGIIIARKVPELSIPPSFSIELDFPVLPLEDFIPPDLSQIEKMLNTDSITEIKKTSRENYLLVVVASGEAVRGVDADIGAVRKYPVRGLIVTGKAPFESEYDIYYRFFCPNLGADEDHVCGSAHCALAPYWSQRLGKNDFVSYTASTRGGVIHVHLDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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