当前解析结果
SmilChr03G003076| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003076 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003076 |
| 描述 | extensin-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 47781488 - 47782284 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018913 |
|---|---|
| GeneID | 131018913 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018913 |
| 原始查询 | SmilChr03G003076 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | extensin-like |
| 产物 | extensin-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018913 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057803584.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057803584.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057803584.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803584.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803584.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:47781498 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B44 |
Chr3:47781498 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr3:47781520 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B68,B88,C45 |
Chr3:47781628 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr3:47781637 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A4,B125,B140,B2,B85 |
Chr3:47781637 |
TTG |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | A4,B125,B140,B2,B85 |
Chr3:47781641 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr3:47781643 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B68,B88,C45 |
Chr3:47781651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr3:47781679 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr3:47781681 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B125,B140,B2,B85 |
Chr3:47781682 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,B76,C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。