当前解析结果
SmilChr03G003082| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003082 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003082 |
| 描述 | protein FANTASTIC FOUR 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 47867970 - 47868925 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016227 |
|---|---|
| GeneID | 131016227 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016227 |
| 原始查询 | SmilChr03G003082 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FANTASTIC FOUR 3-like |
| 产物 | protein FANTASTIC FOUR 3-like |
| Arabidopsis | AT5G19260 (FAF3)FANTASTIC four-like protein (DUF3049) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832046] identity=37.8; qcov=0.676; evalue=5.01e-16; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF11250 (FAF) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016227 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800851.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057800851.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057800851.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800851.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800851.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:47868159 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:47868354 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr3:47868374 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr3:47868385 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B102,B85,C53,D11 |
Chr3:47868626 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,B98,C13,C51,D4 |
Chr3:47868695 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B41,B75,C10,C74 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057800851.1PF11250
FAF 92-140 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057800851.1 |
Pfam | PF11250 |
FAF | Family | 92 | 140 | 1.3e-17 | 64.4 | Fantastic Four meristem regulator |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。