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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003084`

染色体: Chr03 坐标: 47885526-47886527 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003084`
名称	SmilChr03G003084
描述	uncharacterized SmilChr03G003084
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47885526 - 47886527 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018916`
GeneID	`131018916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018916`
原始查询	`SmilChr03G003084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=23.6; qcov=0.866; evalue=4.59e-15; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=24.7; qcov=0.993; evalue=8.48e-17; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803588.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803588.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803588.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803588.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47885571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B104,B46,C76,C8
`Chr3:47885715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B113,B25
`Chr3:47885748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A3,B113,B25
`Chr3:47885748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B113,B25
`Chr3:47885768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47885771`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr3:47885771`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr3:47885816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47885826`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,B26,B74,B78,C56
`Chr3:47885826`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,B26,B74,B78,C56
`Chr3:47885828`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,B26,B74,B78,C56
`Chr3:47885828`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,B26,B74,B78,C56

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947605.1
ATGGGGAAGATCAACGATACGGACCTCAAGCTAATTTGGGGTTCAGATAATGTGGGAGTGGCAGAGAGACAAGCTGACGGTAATGTTGATTGTTGTTTGGTTAATATTTACGCTCCCCAAAGTTTTTCCGATGGAGTCGTGTTATGGGATCAGATCAGTTTGGTGGTGGAACAGAATAAAGATTTGTGTGTCTGTGTCGTGGGTGATTTCAACTCTATCAGAAACGGATCTGAAAGGGTTGGTAGAGGGTCTCAGTTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018916
ATGGGGAAGATCAACGATACGGACCTCAAGCTAATTTGGGGTTCAGATAATGTGGGAGTGGCAGAGAGACAAGCTGACGGTAATGTTGATTGTTGTTTGGTTAATATTTACGCTCCCCAAAGTTTTTCCGATGGAGTCGTGTTATGGGATCAGATCAGTTTGGTGGTGGAACAGAATAAAGATTTGTGTGTCTGTGTCGTGGGTGATTTCAACTCTATCAGAAACGGATCTGAAAGGGTTGGTAGAGGGTCTCAGTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803588.1
MGKINDTDLKLIWGSDNVGVAERQADGNVDCCLVNIYAPQSFSDGVVLWDQISLVVEQNKDLCVCVVGDFNSIRNGSERVGRGSQFQFTDVQSFDSFIRNNNLVELPLQDRKFTWYQPQGQCKTKLDRFLVNDKWLDYWSHSKVRGLQRSVSDHVPILLETKAVFWGPKPFRFLNAWTNHQSFEQVVRESWQKSGITGWSCYVFKEKMKRLKEDLRKWNKSTFGHVEENVIQLKDQIMKWDAIDDALGLDEEEAIKRNEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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