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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003085`

染色体: Chr03 坐标: 47898724-47908199 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003085`
名称	SmilChr03G003085
描述	probable transmembrane GTPase FZO-like, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47898724 - 47908199 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016228`
GeneID	`131016228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016228`
原始查询	`SmilChr03G003085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transmembrane GTPase FZO-like, chloroplastic
产物	probable transmembrane GTPase FZO-like%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G03160` (FZL) FZO-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839566] identity=56; qcov=0.932; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0390100` - identity=52.4; qcov=0.847; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding); GO:0010027 (thylakoid membrane organization); GO:0031969 (chloroplast membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF00350 (Dynamin_N); PF01926 (MMR_HSR1); PF02581 (TMP-TENI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800852.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057800852.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057800853.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800852.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47900440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:47900655`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr3:47900655`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr3:47902033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:47902051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,B94
`Chr3:47902103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B53
`Chr3:47902348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B111,B17
`Chr3:47906898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B104,B46,C8
`Chr3:47906932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C47
`Chr3:47907078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:47907792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47907934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800852.1

912 aa

456

912

TMP-TENI

MMR_HSR1

GTP_EFTU

Dynamin_N

PF02581 TMP-TENI 88-172 aa PF01926 MMR_HSR1 362-494 aa PF00009 GTP_EFTU 362-538 aa PF00350 Dynamin_N 363-408 aa PF00350 Dynamin_N 416-494 aa

XP_057800853.1

705 aa

352

705

TMP-TENI

MMR_HSR1

GTP_EFTU

Dynamin_N

PF02581 TMP-TENI 88-172 aa PF01926 MMR_HSR1 362-494 aa PF00009 GTP_EFTU 362-538 aa PF00350 Dynamin_N 363-408 aa PF00350 Dynamin_N 416-494 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800852.1`	Pfam	`PF02581`	TMP-TENI	Domain	88	172	6.4e-07	29.6	Thiamine monophosphate synthase
`XP_057800852.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	362	494	1.8e-14	54.5	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057800852.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	362	538	7.1e-08	33.0	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057800852.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	363	408	9e-24	85.1	Dynamin family
`XP_057800852.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	416	494	9e-24	85.1	Dynamin family
`XP_057800853.1`	Pfam	`PF02581`	TMP-TENI	Domain	88	172	4.5e-07	30.1	Thiamine monophosphate synthase
`XP_057800853.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	362	494	1.2e-14	55.1	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057800853.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	362	538	3.7e-08	33.9	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057800853.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	363	408	4.8e-24	86.0	Dynamin family
`XP_057800853.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	416	494	4.8e-24	86.0	Dynamin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944869.1
GGATAACGTTCCAATTCATCACCACAACCATAAAAACATGCGAAATTTGTAACTTTCTACTCTCTCACTCCCACCTCCTCCGCCACCGCACCGCCACCGCATCTATGTTAATATCTTCATTTTCCCCATTAACTTCCACTCACCTTTTCCTCTTCCACCACAAATCCTCTCTACGAGCTCCTCCTCGCTCCGCTGCTCCGCGAACCCCCTTCTTCGCTCGCTCCGCCGCTGCGGCGGGTGGAAGGAATGCTGTAATTTCG...

XM_057944870.1
ATTAAGTGGATAACGTTCCAATTCATCACCACAACCATAAAAACATGCGAAATTTGTAACTTTCTACTCTCTCACTCCCACCTCCTCCGCCACCGCACCGCCACCGCATCTATGTTAATATCTTCATTTTCCCCATTAACTTCCACTCACCTTTTCCTCTTCCACCACAAATCCTCTCTACGAGCTCCTCCTCGCTCCGCTGCTCCGCGAACCCCCTTCTTCGCTCGCTCCGCCGCTGCGGCGGGTGGAAGGAATGCTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016228
ATGTTAATATCTTCATTTTCCCCATTAACTTCCACTCACCTTTTCCTCTTCCACCACAAATCCTCTCTACGAGCTCCTCCTCGCTCCGCTGCTCCGCGAACCCCCTTCTTCGCTCGCTCCGCCGCTGCGGCGGGTGGAAGGAATGCTGTAATTTCGAGTTCTATCAACCAGAATCCTCGGAGAAGTTTGTTCCCCGGCGGCTACAAGCGTCCGGAGATCAGAGTGCCGAATCTCGTTCTCCGCCTGAGCTCCGACGACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800852.1
MLISSFSPLTSTHLFLFHHKSSLRAPPRSAAPRTPFFARSAAAAGGRNAVISSSINQNPRRSLFPGGYKRPEIRVPNLVLRLSSDDLCRDERAVIDLVDNAVSDRVGIVVLTGGEGSGKKLYEAACLLKSVIRDRAYLLIDERVDIAAAVSANGVVLSDQGLPTIVARNTMMDARTDSVMLPLVARNVQTFDAALDASDSEGADFLIFTLKGGASHEDLVSSILGSIKIPIFIMADSPMDEISLHSLNSRASGVVVSVDE...

XP_057800853.1
MLISSFSPLTSTHLFLFHHKSSLRAPPRSAAPRTPFFARSAAAAGGRNAVISSSINQNPRRSLFPGGYKRPEIRVPNLVLRLSSDDLCRDERAVIDLVDNAVSDRVGIVVLTGGEGSGKKLYEAACLLKSVIRDRAYLLIDERVDIAAAVSANGVVLSDQGLPTIVARNTMMDARTDSVMLPLVARNVQTFDAALDASDSEGADFLIFTLKGGASHEDLVSSILGSIKIPIFIMADSPMDEISLHSLNSRASGVVVSVDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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