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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003098`

染色体: Chr03 坐标: 48039724-48041670 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003098`
名称	SmilChr03G003098
描述	lignin-forming anionic peroxidase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48039724 - 48041670 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016241`
GeneID	`131016241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016241`
原始查询	`SmilChr03G003098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lignin-forming anionic peroxidase-like
产物	lignin-forming anionic peroxidase-like
Arabidopsis	`AT1G14550` (AT1G14550) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838017] identity=61.1; qcov=0.984; evalue=7.41e-138; confidence=high
Rice	`Os11g0112200` (prx131) - identity=56.6; qcov=0.997; evalue=3.15e-126; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057800879.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057800879.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800879.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800879.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48039935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:48039989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B127,B130,B73,C27
`Chr3:48040967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B59,C39,C64,C66
`Chr3:48041216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C81,D6
`Chr3:48041259`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,A7,B10,B14,B30,B41,B60,B99,C14,C46,C7,D8
`Chr3:48041466`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr3:48041466`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr3:48041469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:48041543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800879.1

321 aa

160

321

peroxidase

PF00141 peroxidase 46-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800879.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	46	285	1.3e-81	274.7	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944896.1
ATGCACGTACGAATGAGTCACATAAGTTGTAAATCATACATCTTAAAATCATTTCCTCTATAAATAGAGCTATACTCCAATCATCATTCATCTAAAATCACTAAATAATACTATTAAATGATTAAGAAGATGATTTCATCCAATTATTATTTTGTTACAGTGGTTATAATCTTGATGTTAAACGTGGCATGCGAGGCACAACTATCTTCGACGTTCTACGATAGTACATGCCCCAATGCGCTTAGTACAATCCGAACATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016241
ATGATTAAGAAGATGATTTCATCCAATTATTATTTTGTTACAGTGGTTATAATCTTGATGTTAAACGTGGCATGCGAGGCACAACTATCTTCGACGTTCTACGATAGTACATGCCCCAATGCGCTTAGTACAATCCGAACATCCATCCGGCAGGCTGTCTCAAGAGAGCGGAGGATGGCCGCATCTCTTGTTCGCCTCCACTTCCACGACTGCTTCGTTCAGGGATGTGATGCATCACTCCTACTGGATGATACAACAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800879.1
MIKKMISSNYYFVTVVIILMLNVACEAQLSSTFYDSTCPNALSTIRTSIRQAVSRERRMAASLVRLHFHDCFVQGCDASLLLDDTTGERVALQNANSVRGFEVVEAAKQAVEAICPGVVSCADVLAVAARDATVAVGGPSWKVTLGRRDSPAAASRSLAETDLPRFTDPLPTLISNFQNKNLNERDMVALSGSHTIGQARCVTFRNRIYSNISIDPGFASTRQRQCPQTNGNGDGNLAPLDLVTPNSFDNNYFKNLIQRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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