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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003104`

染色体: Chr03 坐标: 48177666-48181769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003104`
名称	SmilChr03G003104
描述	F-box protein SKIP17-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48177666 - 48181769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016247`
GeneID	`131016247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016247`
原始查询	`SmilChr03G003104`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP17-like
产物	F-box protein SKIP17-like
Arabidopsis	`AT4G02740` (AT4G02740) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828188] identity=39.8; qcov=0.769; evalue=4.33e-87; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800886.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800886.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800886.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800886.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48177737`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	185	A1,A13,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A7,A8,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B110,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B122,B123,B124,B127,B128,B129,B130,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B5,B52,B53,B54,B59,B6,B60,B64,B65,B66,B68,B69,B70,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C47,C49,C5,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C65,C7,C70,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D6,D8,D9
`Chr3:48177738`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C67
`Chr3:48177738`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C67
`Chr3:48177819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr3:48178076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr3:48181458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800886.1

568 aa

284

568

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 146-190 aa PF00646 F-box 148-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800886.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	146	190	6.4e-09	36.2	F-box-like
`XP_057800886.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	148	185	0.00019	21.9	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944903.1
TGGAATGGACAAAACTGAAATCCACGTGTCACTCACTTGTGTCACTCCGCCCCTAGAGTGTGCTGATTCGCAGCTTCCCAAAACCGCACAAACGCCACAGCAAAAGGAACAAGGAATCCCCACCGCCTCGCGAATCGCCATGGATAGCGCTCTCCTCCACGACGCCGTCGCCGTCTCTCCCAATCCCAAGCTCAAGCGCCCCTGCTGCTACCCGACCTCCGATCCCAATCAATTCGACGCGCTCTTGGAATCCTTCCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016247
ATGGACAAAACTGAAATCCACGTGTCACTCACTTGTGTCACTCCGCCCCTAGAGTGTGCTGATTCGCAGCTTCCCAAAACCGCACAAACGCCACAGCAAAAGGAACAAGGAATCCCCACCGCCTCGCGAATCGCCATGGATAGCGCTCTCCTCCACGACGCCGTCGCCGTCTCTCCCAATCCCAAGCTCAAGCGCCCCTGCTGCTACCCGACCTCCGATCCCAATCAATTCGACGCGCTCTTGGAATCCTTCCTTGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800886.1
MDKTEIHVSLTCVTPPLECADSQLPKTAQTPQQKEQGIPTASRIAMDSALLHDAVAVSPNPKLKRPCCYPTSDPNQFDALLESFLDFHDSSSIALDLAIDRIIESSPHDSEKNDVIDRALRLGSALTEAAKRSARRRASMHNAVVWALPSDLTIKVFSLLDTQSVCHAAATCSFFNKCAADPLCYSNINLTTVVPRVNNIVVSTMIQRAGKVLRSLKLGIVPSPPVASLGSSQALVYSMRNSSDTSGFSWNDKRSRQGKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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