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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003119`

染色体: Chr03 坐标: 48353874-48354685 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003119`
名称	SmilChr03G003119
描述	late embryogenesis abundant protein D-34-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48353874 - 48354685 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016265`
GeneID	`131016265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016265`
原始查询	`SmilChr03G003119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein D-34-like
产物	late embryogenesis abundant protein D-34-like
Arabidopsis	`AT3G22490` (AT3G22490) Seed maturation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821820] identity=48.6; qcov=0.917; evalue=7.42e-28; confidence=medium
Rice	`Os03g0159600` (OsLEA30) - identity=44.8; qcov=1.03; evalue=4.48e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04927 (SMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800896.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800896.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057800896.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800896.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48354117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:48354120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:48354166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:48354440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B75,C33,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800896.1

121 aa

121

SMP

PF04927 SMP 12-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800896.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	12	66	3e-16	60.2	Seed maturation protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944913.1
TATTAATTTTCCCAAAAAATAACAAAATGGTATTCATTTTACAAACGACTTAAAATGGTATTGAGGCAATGCAAGTCCAAGAAAGCGAAAGAGTGGATATGATCGCCGCCGCCTCACTCTACCGCTAAAATCCCATAAAAAGGGCGGGCCTCATCAACTTAACCCCATGTGAGAATGAATCAGGAGAAGCCAGCGAAGGCCGAAGCCATCAAATACGGCGACGTTTTCAACGTCTCCGGCGACCTAGCCGCTAAACCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016265
ATGAATCAGGAGAAGCCAGCGAAGGCCGAAGCCATCAAATACGGCGACGTTTTCAACGTCTCCGGCGACCTAGCCGCTAAACCCATAACACCAAAAGACGCCGCCGCAGTGGAGTTGGCGGAGAACCTCGTATTGGGGGAGAATCCCAAGAGTGGGATGGCAACCGTCATGAAATCGGCGGCGGAGCTCAACGAGCGCCGCGGCTTTGTTCGGCACGACGACACGACCGACGTGGTTAGGGACGGCGGAACCGAAATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800896.1
MNQEKPAKAEAIKYGDVFNVSGDLAAKPITPKDAAAVELAENLVLGENPKSGMATVMKSAAELNERRGFVRHDDTTDVVRDGGTEIAETTVVGHRLVTESIGGQLLGRFAMDDKASRGSPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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