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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003128`

染色体: Chr03 坐标: 48457808-48459867 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003128`
名称	SmilChr03G003128
描述	protein SPIRAL1-like 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48457808 - 48459867 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018920`
GeneID	`131018920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018920`
原始查询	`SmilChr03G003128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SPIRAL1-like 1
产物	protein SPIRAL1-like 1
Arabidopsis	`AT1G26355` (SP1L1) SPIRAL1-like1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240366] identity=67.5; qcov=0.781; evalue=2.59e-46; confidence=medium
Rice	`Os12g0502000` - identity=52.6; qcov=0.651; evalue=1.52e-23; confidence=medium
GO	GO:0010005 (cortical microtubule, transverse to long axis); GO:0043622 (cortical microtubule organization)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803592.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803592.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057803592.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803592.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48457981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:48458629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:48458772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:48458834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B98,C51,D4
`Chr3:48459816`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	165	A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B17,B18,B20,B21,B24,B27,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B46,B47,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C11,C15,C18,C19,C2,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C41,C42,C44,C46,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C57,C58,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C74,C75,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C9,D1,D10,D2,D5,D8
`Chr3:48459821`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B118,B41,C10,C74
`Chr3:48459821`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B118,B41,C10,C74
`Chr3:48459822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B19

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947609.1
ATGGAGCACGAGGTTACTGCTTCCAGTCATTTATTGAATCTTACAGGGGGGCTGATTAAGATTGTAACTTTTGATCATAGACGAATAGGAGATATAGATCGTGGAGTTAGCAGCGGTGGAGGGCAGAGTTCGTTGGGTTACTTGTTTGGTAGCGGTGAGGCTCCAAAACCAGCAGTGGGGAAAACACAAACTGTACCGAGTGAGAGTAGTGTTGCTAGTAAAGAACCTTCGCCAAAGCCTAATGCCGCTCCTAAGCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018920
ATGGAGCACGAGGTTACTGCTTCCAGTCATTTATTGAATCTTACAGGGGGGCTGATTAAGATTGTAACTTTTGATCATAGACGAATAGGAGATATAGATCGTGGAGTTAGCAGCGGTGGAGGGCAGAGTTCGTTGGGTTACTTGTTTGGTAGCGGTGAGGCTCCAAAACCAGCAGTGGGGAAAACACAAACTGTACCGAGTGAGAGTAGTGTTGCTAGTAAAGAACCTTCGCCAAAGCCTAATGCCGCTCCTAAGCCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803592.1
MEHEVTASSHLLNLTGGLIKIVTFDHRRIGDIDRGVSSGGGQSSLGYLFGSGEAPKPAVGKTQTVPSESSVASKEPSPKPNAAPKPVDVSKQIPAGIHSSTTKNYVRADGQSTCNFITDRPSTKVHAAPEGGSSLGYLFGGGSSSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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