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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003134`

染色体: Chr03 坐标: 48580761-48591717 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003134`
名称	SmilChr03G003134
描述	protein SPIRAL1-like 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48580761 - 48591717 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016279`
GeneID	`131016279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016279`
原始查询	`SmilChr03G003134`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SPIRAL1-like 1
产物	protein SPIRAL1-like 1
Arabidopsis	`AT1G26355` (SP1L1) SPIRAL1-like1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240366] identity=71.2; qcov=0.949; evalue=2.87e-48; confidence=medium
Rice	`Os03g0417800` - identity=75; qcov=0.513; evalue=2.27e-25; confidence=medium
GO	GO:0010005 (cortical microtubule, transverse to long axis); GO:0043622 (cortical microtubule organization)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800910.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800910.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057800910.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800910.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48581032`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B46,C44
`Chr3:48581032`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B46,C44
`Chr3:48581033`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B46,C44
`Chr3:48581033`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B46,C44
`Chr3:48581052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C74
`Chr3:48581712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:48581717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C29,D2
`Chr3:48581728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944927.1
CTCCATCCTTGATTCTTGTGGAATAAAGAAACTAGTCGAGGACAACAAGAGAAAAGAGAGCAAAGAAGTGTGATCAATAAAGGGGAAAAAGAGGACGACGAGTGAAGGAGAACAAGAAAAAAGAGCAAGGCAAAAAAAAAATTAAGCTTGTAACTTTTGATCATAGACGAATATGAGATATGGGTCGTGGAGTTAGCAGCGGTGGAGGGCAGAGTTCATTGGATTACTTGTTTGGTTGCGGTGAGGCTCTAAAACTAGCA...

XM_057944929.1
AGAGAGAAGCTTCTATATCCACTCCGAAATTACTCCCTCCACTCTCGCACCATCACTCATTGGCTGTCCTTCCACTAAATTCCAAATTCTACATTGCCAGCCCCCACTGGAAGATTCAATAAATGACTGGAAGCGGTAACCTCGTGCTCCATAATACTTTTCATGGCTCCATACGGTAGATCTGATCAAGAAAAGGTGAAAGATTAAGCTTGTAACTTTTGATCATAGACGAATATGAGATATGGGTCGTGGAGTTAGCA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131016279
ATGGGTCGTGGAGTTAGCAGCGGTGGAGGGCAGAGTTCATTGGATTACTTGTTTGGTTGCGGTGAGGCTCTAAAACTAGCAGTGGGGAAAGCACAAGCTGCATCGAGTGAGAGTAGTGTTGCTAGTAAAGAACCTTCGCCAAAGCCTAATGCCGCTCCTAAGCCAGTAGACGTTAGCAAGCAGATTCCTGCAGGGATTCATAGTAGCACCACCAACAACTACGTCAGAGCAGATGGTCAGAGTACTTGCAATTTTATCAC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057800910.1
MGRGVSSGGGQSSLDYLFGCGEALKLAVGKAQAASSESSVASKEPSPKPNAAPKPVDVSKQIPAGIHSSTTNNYVRADGQSTCNFITDRPSTKVHAAPGGGSSLGYLFGGGSGSSSN

XP_057800911.1
MGRGVSSGGGQSSLDYLFGCGEALKLAVGKAQAASSESSVASKEPSPKPNAAPKPVDVSKQIPAGIHSSTTNNYVRADGQSTCNFITDRPSTKVHAAPGGGSSLGYLFGGGSGSSSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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