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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003138`

染色体: Chr03 坐标: 48615786-48618697 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003138`
名称	SmilChr03G003138
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48615786 - 48618697 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016290`
GeneID	`131016290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016290`
原始查询	`SmilChr03G003138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190-like
Arabidopsis	`AT4G21190` (emb1417) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827867] identity=65.8; qcov=0.906; evalue=3.81e-123; confidence=high
Rice	`Os01g0757700` - identity=65.6; qcov=0.638; evalue=1.27e-85; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800933.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057800933.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800933.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800933.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48616627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B85,C18,C2
`Chr3:48617541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,C11,C69,C83,D1
`Chr3:48618315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:48618498`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr3:48618498`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr3:48618559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800933.1

287 aa

144

287

PPR

PF01535 PPR 126-148 aa PF01535 PPR 166-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800933.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	126	148	4.3e-07	30.5	PPR repeat
`XP_057800933.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	166	191	4.3e-07	30.5	PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944950.1
AATACTTTATTAGCCTTCACCTCTAATCCATATTTCTTCCTATTCTCACGCTACCAGCTCAGCTCGTCTGCAATCTCTCTCTGTTTTCCGCCGCTCGTCGCCCCCTCCGGCCCTCGAAATCTCTACAGCAACAGCCTGCGCCGTGCTCCGCCTCACTGTGCTGCCTATCAGTTTTCGTCGTCCTGCTTCCTCCGGCCTCGGCCCATCCGTCTGGCGACTCTTTAGCAGCTCTGCCGACACCTCCCCAACCCAACACCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016290
ATGCTAAGTTTGAGGCATTCTCTTGTAACTATCAATATAGGATTGCAGACAGTTGTATTTGGGAATAATCGGTATCGATGTCCGGTGGAATGTGCTGCTAAAGGTCCTCGACCAAGGTACCCTCGCGTATGGAAAACCAAAAAACGGATAGGGACCATTTCAAAGTCCCGAAAGTTTGTCGAATGTATAAAGGGATTATCAAATGTCAAAGAGGAAGTATATGGGGCTCTTGATTCCTTCATTGCTTGGGAACTAGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800933.1
MLSLRHSLVTINIGLQTVVFGNNRYRCPVECAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKSRKFVECIKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKSLENEKQWKRIIQVTKWMLSKGQGRTMGSYYTLLNALAEDGRIEEAEELWQTLFTQNIESMPRMFFERMISIYYQREMHGKMFEIFADMEELGIRPNVPIVTMVGEVFKKLDMLDKYEKLNRKYPPPKWEYRYIKGKRVKIRSKFADNNEANSCDIEASSDAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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